TPD薬物ターゲティング性能タンパク質群分析
バイオテクノロジーの急速な発展に伴い、医薬品開発は精密化、個別化の新しい時代に突入しています。ターゲットプロテインデグラデーション(TPD)薬は新しい治療戦略であり、体内のユビキチン-プロテアソームシステムを利用して特定の病的タンパク質を分解し、精密な治療を実現します。TPD薬は重要な新型治療薬としてますます注目を集めており、イノベーションが進んでいます。特定疾患ターゲット(TPD)の薬物設計は、現在の医薬品開発分野のホットトピックとなっています。
プロテオミクスは、生物体内のタンパク質の組成、構造、機能および相互関係を研究する科学であり、薬物とタンパク質の相互作用を包括的に明らかにすることができます。プロテオミクス技術を組み合わせることで、TPD薬のターゲット特性を深く探求し、薬物の最適化設計および臨床応用に重要な基盤を提供します。
バイテックバイオテクノロジー(BTP)は、Thermo社のObitrap Fusion Lumosなどの高分解能質量分析計を使用してTPD薬のターゲット特性プロテオミクス分析プラットフォームを構築し、全プロテオミクス技術に基づくTPD薬のターゲット分解特性分析サービスを提供しています。1回の実験で8000-10000種の全タンパク質を識別可能で、提供する分析サービスには以下が含まれますが、これに限定されません:
• ターゲットタンパク質の分解活性(Target protein degradation activity)分析:
データ非依存取得(Data Independent Acquisition、DIA)技術とプロフェッショナルなタンパク質検索ソフトウェアを使用し、従来のDDA技術を代表とするTMT/iTRAQのラベル定量技術と比較して、より包括的にプロテオミクスをカバーし、対象タンパク質(Protein of Interest、POI)の定量精度を効果的に向上させます;
• ターゲット選択性(Target selectivity)分析:
差異プロテオミクス分析を通じてPOIおよびその他の差異タンパク質の変化を評価し、TPD薬のターゲット選択性を総合的に評価します;
• 潜在的なオフターゲットリスクおよび安全性問題(Potential off-target and safety concerns)分析:
TPD薬のターゲット選択性結果に基づき、多プラットフォームデータベース分析を統合し、TPD薬の潜在的なオフターゲットリスクおよび安全性問題を探求します;
• 生物学的機能および作用機序(Biological functions and mechanisms of action)分析:
PPI、GO、KEGGなどの古典的なバイオインフォマティクス機能分析戦略を採用し、TPD薬が媒介する生物学的機能およびその作用機序を探求します。
実験設計およびプロセス
• サンプル準備:適切な濃度、時間点の実験設計;
• サンプル前処理:全タンパク質抽出、タンパク質酵素切断;
• 質量分析取得:DIA取得、DIANNデータベース検索;
• データ処理:自動化分析プロセス、個別化分析プロセス。

図1. TPD薬のターゲット特性プロテオミクス分析実験フロー
適用サンプルタイプ
• 細胞沈殿:各グループに少なくとも1つの処理グループ、1つの対照グループ、各グループに少なくとも3つのサンプルを推奨;
• 組織サンプル:各グループに少なくとも1つの処理グループ、1つの対照グループ、各グループに少なくとも5つのサンプルを推奨。
結果納品

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