質量分析に基づく配列解析

質量分析に基づくタンパク質、抗体、ペプチドなどのサンプルの配列分析は、サンプルのアミノ酸配列の分析です。質量分析によるシーケンシングとは、質量分析に基づいてサンプルの一次構造アミノ酸配列を決定することを指します。質量分析シーケンス分析に入る前に、いくつかの定義を簡単に紹介します。アミノ酸はアミン（-NH2）およびカルボキシル基（-COOH）の官能基と、各アミノ酸に特有の側鎖（R基）を含む有機化合物です。ペプチドはペプチド結合によって結合された2～50個のアミノ酸からなる短鎖です。ポリペプチドはより長く、連続した分岐のないペプチド鎖で、最大約50個のアミノ酸を含む長いペプチド鎖です。50個以上のアミノ酸を含むポリペプチド/ペプチド鎖はタンパク質と呼ばれます。タンパク質は、生物学的機能基で配置された1つまたは複数のポリペプチドで構成され、通常はリガンド（補酵素や補因子など）、別のタンパク質、他の大分子（DNAやRNAなど）、またはより複雑な大分子アセンブリに結合することができます。抗体（Ab）、または免疫グロブリン（Ig）は、主に形質細胞によって生成される大きなY字型のタンパク質で、免疫系によって病原体（細菌やウイルスなど）を中和するために使用されます。

関連サービス：

質量分析に基づくタンパク質シーケンシング
 質量分析に基づく抗体シーケンシング
 質量分析に基づくペプチドシーケンシング

Edman分解法と比較して、質量分析法のシーケンシングの利点は、質量分析法がより感度が高く、ペプチドをより速く分解でき、末端が閉じているまたは修飾されているタンパク質サンプルを識別できることです。バイタイパークバイオテクノロジーは、既存の高解像度質量分析技術プラットフォームを利用して、質量分析に基づくシーケンス分析サービスを提供し、測定されたターゲットタンパク質配列の100％のカバレッジを実現できます。

質量分析シーケンシングの示意図

タンパク質サンプルのシーケンス分析プロセスでは、一般的にトリプシンを使用してタンパク質を酵素切断し、同定されたペプチド断片のカバレッジは約60％です。ターゲットタンパク質の完全な配列情報を得るために、バイタイパークバイオテクノロジーは、タンパク質シーケンス分析プロセスで一般的に使用される6種類のプロテアーゼ（トリプシン、キモトリプシン、Asp-N、Glu-C、Lys-C、Lys-N）を選択して、ターゲットタンパク質を個別に酵素切断および質量分析し、断片化ペプチド断片を得ると同時に、ペプチド断片間の接続を通じてタンパク質シーケンスの100％測定を完了します。バイタイパークは、Thermo社が最新に発表したObitrap Fusion Lumos質量分析計を使用して、タンパク質サンプルのシーケンス分析を実現します。Obitrap Fusion Lumos質量分析計は、現在の解像度と感度が最も高い質量分析計で、低濃度ペプチド断片の識別感度を保証します。同時に、ペプチド断片化プロセスでHCDとETDの組み合わせモードを採用し、ペプチド断片の完全性を保証します。タンパク質サンプルのN末端、C末端シーケンス分析、タンパク質全長シーケンス分析を実現できます。未知の理論配列のサンプルについては、デノボシーケンシング法による配列分析が可能です。