タンパク質質量分析同定

単一タンパク質またはタンパク質混合物のプロテオーム解析/分析、および単一タンパク質のタンパク質配列分析は、生物学研究において頻繁に遭遇する問題です。質量分析法に基づいてタンパク質の配列情報を取得し、質量分析法を使用してタンパク質の質量分析を行い、プロテオーム解析を通じてタンパク質の同定を実現します。つまり、LC-MSに基づくプロテオーム解析によるタンパク質の同定です。一般的な分析には以下が含まれます：質量分析によるタンパク質分子量の測定，タンパク質のN末端およびC末端のシーケンス，タンパク質配列分析および，翻訳後修飾部位の分析など。

百泰パックバイオテクノロジーは、Thermo社が最新に発表したObitrap Fusion Lumos質量分析計とNano-LCナノ流量クロマトグラフィー技術を組み合わせて、タンパク質抽出物、SDS-PAGEタンパク質バンド、2Dタンパク質ゲルスポット、pull-downおよびCo-IPなどのサンプル中のタンパク質を高効率で正確にプロテオーム解析サービスを提供します。

百泰パックは以下のタンパク質質量分析サービスを提供できます：

1. 純化タンパク質に対するタンパク質質量分析/質量分析同定；
2. タンパクゲルスポット、タンパク質ゲルストリップ質量分析同定、タンパク質銀染色ゲル質量分析同定、考染/蛍光/Zn/Cu2+などのタイプの染色のゲルスポット/ゲルストリップサンプルを同定；参考：タンパクゲルスポット、ゲルストリップ、IPサンプルタンパク質同定サービス；
3. pull-downタンパク質質量分析同定、IPタンパク質相互作用のIP-MS相互作用タンパク質同定、Co-IP質量分析による相互作用タンパク質の検証、免疫共沈と質量分析による検証などの簡単な混合物サンプル中のタンパク質サンプルをタンパク質同定/分析；
4. 複雑なサンプル中の未知タンパク質に対するプロテオーム解析/質量分析によるタンパク質同定。非常に低濃度のタンパク質サンプルでもタンパク質質量分析により同定可能です。

単一タンパク質および簡単なタンパク混合物の同定については、100%の同定率を保証し、そうでなければ料金はいただきません。

NanoLC-MS/MSによる簡単または複雑な混合物中のプロテオーム解析。サンプルはSDS-PAGEゲルからのバンドまたはタンパク質スポット、または溶液サンプルであることができます。（当社は1Dまたは2D SDS-PAGEサービスも提供しています。詳細をクリックしてご確認ください。）

百泰パックによる質量分析に基づくタンパク質同定例

百泰パックによる質量分析に基づくプロテオーム解析プロセス:

サンプル前処理
まず、ジチオトレイトール（DTT）でタンパク質サンプルを還元し、ヨウ化エチルアミン（IAA）でアルキル化します。次にトリプシンでサンプルを消化し、通常のサンプルはリシンおよびアルギニン残基の後で切断されます。最後に凍結乾燥してペプチドフラグメントを得ます。

機器分析
サンプルをNanoLCのA相で再溶解後、NanoLC-MS/MSシステムで分析します。

データベース検索
サンプルの生物種の出所に基づいてUniProtから対応する生物種のプロテオームデータベースをダウンロードし、MaxQuant、Proteome Discoverer、Peaksなどのソフトウェアを使用して、液質連用によって得られたデータをデータベース中のデータと一致させ、ペプチドフラグメントの一次および二次フラグメントの質量を通じてデータベースで一致するタンパク質を見つけ、サンプル中のタンパク質を同定します。

サンプルの生物種にまだ完全なプロテオームデータベースがない場合、近縁な生物種のプロテオームデータベース、または同じモデル生物のプロテオームデータベースを使用してタンパク質同定分析を行います。

報告書の発行
同定報告書には、詳細なサンプル前処理ステップ、クロマトグラフィー-質量分析プラットフォームのパラメータ、および同定されたタンパク質リストとペプチドフラグメントリストが含まれます。質量分析の生データはクラウドストレージ形式で提供されます。

サンプルを収集して提供していただくだけで、後続のすべてのステップは当社が完了します。百泰パックが提供する質量分析に基づくプロテオーム解析/質量分析サービスには以下が含まれます：サンプル前処理-還元アルキル化後、特異性の高いタンパク質酵素を使用してタンパク質サンプルを消化し、ペプチドフラグメントを得る；機器分析-ナノフロークロマトグラフィー（nano-flow）と高分解能質量分析を組み合わせて、最高の感度でペプチドフラグメントを分離し、超高分解能質量分析計を使用してペプチドフラグメントの質量データを収集；データベース検索-サンプル生物種に対応するプロテオームデータベースを使用して、数千の質量分析図を分析（Uniprotデータベースを使用し、毎月データベースを更新して最新データを確保）、サンプル中のタンパク質のプロテオーム解析を実現する；最終的にサンプル報告書を発行、これらはすべて百泰パックがワンストップで完了します：

1. 客様は一種または複数のタンパク質を含むサンプルを提供します、例えばゲルストリップ、ゲルバンド、溶液または固体サンプル、pull-downまたはCo-IPサンプル。
2. 百泰パックはサンプルの状況に基づいて適切な酵素を選び、提供されたサンプルを酵素消化し、nanoLC-MS/MS分析を行います。
3. 取得したデータをデータベース検索分析します。
4. 10-15営業日以内に報告書を受け取ります。

*サンプルに洗剤/溶解剤が含まれている場合は、サンプル送付書に記載してください。