相互作用タンパク質質量分析同定
相互作用タンパク質スペクトル同定は質量分析技術を用いてタンパク質相互作用を研究する方法です、その免疫(共)沈殿、アフィニティ精製などの方法でターゲットタンパク質複合体を分離します;次にプロテアーゼ消化を用いてペプチドを生成し、液相クロマトグラフィー-質量分析連携技術(LC-MS/MS)でペプチドを分析します。最終的に、質量分析データに基づいてバイオインフォマティクスツールと組み合わせて相互作用タンパク質を同定および定量化します。相互作用タンパク質の質量分析による同定は、相互作用するタンパク質を識別または検証し、ターゲットタンパク質と相互作用する新しいタンパク質を発見します。相互作用タンパク質を同定および定量化し、生体内におけるタンパク質のシグナル伝達経路を解明し、薬物標的の発見やバイオマーカー研究を支援します。薬物開発の根拠を提供します。。
BTP BiotechのBaitai Parkerは、Thermo FisherのOrbitrap Exploris 240質量分析プラットフォームとNano-LCを組み合わせたワンストップ相互作用タンパク質質量分析サービスを提供しており、IP、Co-IPサンプル、GST融合タンパク質プルダウンなどの精製サンプル中のタンパク質/タンパク質混合物の質量分析を行います。タンパク質サンプルの同定前処理プロセスは、Nature Methodsに発表された記事「プロテオーム解析のためのユニバーサルサンプル調製法」に従って厳格に実施され、同定試験においてより高いペプチドカバレッジが得られるようにします。
バイタイパーカーバイオテクノロジーBTP相互作用タンパク質質量分析による同定プロセス
1.タンパク質抽出:
最適な方法を採用して細胞または組織サンプルからタンパク質を抽出し、タンパク質の純度と濃度を測定し、抽出物の品質を確保する。
2.相互作用タンパク質の取得:
実験の要件に応じて免疫を利用して(共)沈殿、(GST)Pull-downまたはウエスタンブロッティング手法により、ターゲットタンパク質およびその相互作用タンパク質を濃縮する。
3洗脱と濃縮:
ターゲットタンパク質複合体を結合媒体から洗脱する、濃縮するそして、次のステップの質量分析のためにタンパク質サンプルを収集します。
4.タンパク質酵素解消:
する洗脱した相互作用タンパク質群サンプルに対して複数のタンパク質酵素(例えば、トリプシン)で酵素消化を行い、ペプチドを生成します。
6.ペプチドの分離と精製:
利用して高効率液体クロマトグラフィー(HPLC)または逆相高効率液体クロマトグラフィー(RP-HPLC)技術酵素分解されたペプチドの分離と精製を行う。
7.質量分析:
液体クロマトグラフィー-質量分析(LC-MS/MS)によるペプチドの質量分析を行い、質量データを取得する。
8.データ処理と分析:
質量データに対してデータベース検索とバイオインフォマティクス解析を行う。定性定量相互作用タンパク質の同定質。
私たちの強み
1.高い感度高い正確性:
私たちの質量分析技術可能複雑な生体サンプル中で正確に検出する相互作用タンパク質、たとえ低濃度であっても相互作用タンパク質も識別可能,非常に高い感度を持つ。
2.ハイスループット:
質量分析技術は短時間で大量のタンパク質を識別し定量することができ、研究者の時間と実験コストを節約する。
3.多様なタンパク質相互作用の種類:
私たちのサービスは、ホモ相互作用、ヘテロ相互作用、一時的相互作用、永久的相互作用など、さまざまなタンパク質相互作用の種類を網羅しています。
4.相対的無偏倚性:
従来の遺伝子チップや酵母二重ハイブリッド技術に比べて、質量分析技術はタンパク質相互作用の検出において相対的に低い偏倚性を持っています。
5.多用途性:
質量分析技術は、細菌、酵母、植物、動物、人間などのさまざまな生物システムに適用でき、多くの生物学的研究分野を支援します。
6.豊富な構造情報:
質量分析技術は、タンパク質の翻訳後修飾、スプライシング、タンパク質間相互作用など、さまざまな構造情報を提供し、研究者がタンパク質の機能と調節メカニズムを深く理解するのを助けます。
サンプルについて
1.総タンパク質抽出物:細胞、組織または生物体から抽出可能です。実験の成功を確実にするために少なくとも100 µgのタンパク質を提供することをお勧めします。
2.タンパク質の濃縮:特定のターゲットタンパク質の相互作用タンパク質を識別するために、IP、Co-IPサンプルおよびGST融合タンパク質プルダウンなどで精製されたサンプル中のタンパク質/タンパク質混合物を提供することができます。少なくとも50 µgの濃縮タンパク質を提供することをお勧めします。
中/英語プロジェクトレポート
技術レポートでは、百泰派克は詳細な中英二言語版の技術レポートを提供します。レポートには以下が含まれます:
1. 実験手順(中英語)
2. 関連する質量分析パラメータ(中英語)
3. 相互作用タンパク質スペクトル識別の詳細情報
4. 質量分析画像
5. 生データ
相互作用タンパク質スペクトル識別ワンストップサービス
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バイタイパークのワンストップサービス:サンプル処理-機器分析-データ解析-プロジェクトレポート
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