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メタボロミクス学生バイオインフォマティクス分析

代謝学研究において使用されるハイスループット法は、大量の代謝分析関連データを生成します。これには、バイオインフォマティクスの方法を用いて処理する必要があります。バイタイパーク社のバイオインフォマティクス分析者は、代謝学データの知識を深く掘り下げ、包括的に分析することができます。質量分析の生データをもとに、ピークのアライメント、保持時間の補正、およびピーク面積の抽出を行います。代謝物の構造同定には、精密質量数のマッチング(<25 ppm)と二次スペクトルのマッチングを使用し、METLINデータベースとHMDBデータベースを検索します。二つのグループを比較する際に、両グループ内で欠失値が50%を超えるイオンピークを削除します。その後、データを正規化します(autoscalingまたはUV法を使用)。バイタイパークはMetaboAnalysis、SIMCA-Pソフトウェアを使用して多次元統計分析と単次元統計分析を行い、PCA、PLS-DA、OPLS-DA、そして経路濃縮分析を含め、包括的で正確な代謝学分析結果を提供します。

代謝学バイオインフォマティクス分析

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