単一細胞プロテオミクス分析サービス

シングルセルプロテオミクス分析は、組織から分離された単一細胞に対してプロテオミクス分析を行う手法で、単一細胞内のタンパク質の構成、存在量、修飾状態などを調査します。従来のプロテオミクス研究と比較して、シングルセルプロテオミクスの利点は、単一細胞の情報を取得し、細胞タイプ特異的な差異発現分析を行えることです。これにより、細胞の不均一性、生物系の複雑性、および疾患メカニズムに革新的な洞察を提供し、細胞の挙動と機能をより精密なレベルで研究することが可能です。癌研究、免疫学、発生生物学などに非常に適しています。

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シングルセルプロテオーム（Nat Methods 20, 324–326 (2023).）

細胞は、現在までに発見された生物の基本的な構造および機能単位であり、すべての生命活動の基盤です。多細胞生物において、細胞間の変異性は非常に重要です。例えば、腫瘍は癌細胞、線維芽細胞、免疫細胞、内皮細胞を含む多様な細胞タイプから構成されており、各細胞タイプはさらに異なる細胞群から成り立っています。これらの細胞間の密接な相互作用は、腫瘍の微小環境内の細胞を誘導して腫瘍の成長を支持することがあります。細胞の高度な不均一性のため、従来のプロテオミクスはこれらの微細な差異を反映することができません。特異的な細胞サブグループが癌の発生、発展、転移、免疫逃避に与える影響を探究したり、サブグループの遺伝子やタンパク質を探索して癌の革新的な標的を見つけるためには、シングルセルプロテオミクス分析が必要です。

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腫瘍微小環境（Cancer Discov (2021) 11 (4): 933-959.）

百泰派克バイオテクノロジーのシングルセルプロテオミクス分析サービス

百泰派克バイオテクノロジーは、Thermoの最新鋭Orbitrap Astral高分解能質量分析計とBrukerのtimsTOF HT機器を基に、完全なプロセス統合の自動化シングルセル分離プラットフォームCellenONEを搭載し、高度に不均一な生物サンプルにおいて精密なシングルセルプロテオミクスの安定した検出分析を実現しています：

選択が穏やか：圧電音響分配技術を使用し、剪断応力と損失率が低く、細胞の生存率が高い；
光学モニタリング：高度な視覚処理技術を使用し、ソフトウェア統合の視覚フィードバックにより後続の選択操作を自動判断；成功率が高い；
損失率が低い：単一細胞分離率は98%に達し、複数の細胞を含む液滴は再度分配のために回収される；全プロセスは自動化；

選択された単一細胞は、基本的に無損のタンパク質前処理方法で酵素切断され、得られたペプチドは最新の高感度Thermo Orbitrap Astral機器で検出され、データ品質を保証し、顧客が最も完全なシングルセルプロテオミクスの図を取得できるようにします。

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シングルセルプロテオミクス分析プロセス

シングルセルプロテオミクス分析の利点

過去10年間、大量の単一細胞を対象とした通常の単一細胞RNAシーケンスは、複雑な生物系の潜在的な不均一性の理解を大幅に向上させました。技術の進歩により、タンパク質の測定も可能となり、複雑な組織に存在する細胞タイプと状態をさらに明らかにすることができます。単一細胞トランスクリプトーム分析と比較して、シングルセルプロテオミクス分析には多くの利点があります：

1. タンパク質との関連性が高い：バルクレベルのトランスクリプト情報とタンパク質との関連性は約0.5で、単一細胞レベルの関連性は約0.2です（Mol Syst Biol (2022)18: e10798）

2. タンパク質の翻訳後修飾情報を反映：PTMはタンパク質の種類を大幅に豊富にし、タンパク質の機能を調整します。この情報はmRNAには反映されていません

3. メカニズムが異なる：mRNAの発現調節とタンパク質の活性調節は異なるメカニズムであり、トランスクリプト変異とタンパク質結果には良好な関連性がありません。これらのデータは相補的な役割を果たすことができます

4. タンパク質の結果は比較的安定で、より真実に近い細胞レベルの発現プロファイル：タンパク質の視点から細胞間の不均一性と個体間の差異を解決し、細胞状態の差異、細胞構成の変化を発見し、生理病理現象を明らかにし、新しい治療標的を見つけるのに役立ちます（Mol Cell. 2022;82(12):2335-2349）

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