膜タンパク質群分析

膜タンパク質は細胞膜上に存在する特殊なタンパク質であり、物質輸送、シグナル伝達、エネルギー変換、細胞間コミュニケーションなど多くの生命過程で重要な役割を果たしています。膜タンパク質プロテオミクスは、膜タンパク質の構造、機能、相互作用、および様々な生物過程における変化を研究する科学です。膜タンパク質は疎水性の脂質二重層に埋め込まれているため、従来の水溶性タンパク質分離および精製方法では処理が難しく、膜タンパク質の抽出と精製は困難な課題となっています。また、膜タンパク質の構造の多様性と複雑さは、識別と特性分析をさらに困難にしていますが、質量分析技術、生物情報学、その他の技術の発展により、これらの問題は徐々に解決されつつあります。

BTPバイオテクノロジーズは、Thermo FisherのOrbitrap Exploris 240質量分析プラットフォームとnanoLC-MS/MSナノスケールクロマトグラフィーを組み合わせて、細胞膜タンパク質プロテオーム、ミトコンドリア膜タンパク質プロテオーム、葉緑体膜タンパク質プロテオームなどの定性および定量分析を含むワンストップサブセルラープロテオミクス分析サービスを提供しています。

BTPバイオテクノロジーズの膜タンパク質プロテオミクス分析の一般的なプロセス

1.膜タンパク質の分離と濃縮

細胞または組織を分離および破壊した後、遠心分離などの方法で細胞膜またはサブセルラー構造を分離し、膜タンパク質を抽出してさらに分離精製します。

2.タンパク質の酵素分解

様々なプロテアーゼを使用して膜タンパク質を小分子ペプチドに酵素分解し、後続の質量分析に備えます。

3.ペプチドの分離

酵素分解されたペプチドは、高性能液体クロマトグラフィーによってさらに分離精製されます。

4.質量分析機への投入

分離精製されたペプチドを質量分析にかけ、ペプチドイオンの質量電荷比などの質量分析データを記録します。

5.質量分析データの解析

収集した質量分析データ情報を適切なタンパク質データベースと組み合わせて、膜タンパク質の定性および定量識別を実現します。

6.生物情報学的分析

得られたタンパク質データをさらに分析し、タンパク質の分類、機能予測、経路分析、サブセルラー定位などを行います。

膜タンパク質プロテオミクス解析技術の利点

1.低濃度の膜タンパク質を含む、高スループット、高解像度の膜タンパク質の識別を実現できます。

2.多次元、多層的な技術で膜タンパク質を研究し、包括的な膜タンパク質情報を提供します。

3.トランスクリプトーム、メタボロームなどの他のオミクス技術と組み合わせて、システム生物学の観点から膜タンパク質の機能と作用メカニズムを探求できます。

サンプルについて

サンプルタイプ	細胞	組織	尿	血清、血漿	微生物	原生質球または細胞小器官
サンプル数	10^6-10^7個	50-100mg	1-2ml	50-200uL	10^8-10^9個	1-1000ug