16S/18S/ITS増幅子シーケンシング
アンプリコンシーケンスは特定の長さのPCR産物または捕捉された断片をシーケンスすることであり、現在は主に特定の環境中の特定の遺伝物質をシーケンスするためにハイスループットシーケンシング技術が適用されています。ほとんどの天然微生物は従来の分離培養法では分離およびクローニングができず、これは天然微生物の定性および定量、微生物多様性の探求にとって深刻な課題です。アンプリコンシーケンスは従来の分離培養の弱点を克服し、サンプル中の微生物を定性および定量化することができ、現在微生物多様性検出に広く応用されています。
16Sおよび18S rDNAは細菌および真菌中の16Sまたは18S rDNA遺伝子の高度可変領域であり、ITS（内部転写スペーサー）は細菌、真菌、および古細菌中の小サブユニットと大サブユニットrRNA遺伝子間のインターバル領域DNAです。これらの特定の遺伝物質には進化的保守性および進化的可変領域が含まれます。PCR増幅が容易で、少量のDNAからも増幅でき、さらに遺伝子配列は近縁種間でも高度に変異しているため、アンプリコンシーケンスは分類学および分子系統学において広く応用されています。
研究目的に応じてアンプリコンシーケンスは以下の製品タイプに細分化されます：
16S rDNAシーケンス：16S rDNAは16S rRNAをコードする遺伝子であり、すべての細菌ゲノムに存在します。16S rDNAは異なる菌属間の差異を示すことができ、シーケンス技術を用いてその配列を比較的容易に得ることができ、現在病原菌の検出および同定に広く利用されています。16S rRNAの可変領域は異なる微生物群集の属または種の系統進化分類にしばしば使用されます。
18S rDNAシーケンス：18S rDNAは真核生物のリボソーム小サブユニットrRNAをコードするDNA配列です。構造上、保守領域と高度可変領域に分かれ、保守領域は生物種間の親縁関係を反映し、高度可変領域は種間の差異を反映します。18S rDNAはITSに比べて進化速度がより保守的です。
ITSシーケンス：真核生物において、18S rDNAと28S rDNAの転写間隔配列はITS領域と呼ばれます。ITSは非転写領域であるため選択圧力が小さく、変異が強いです。ITSは中程度の保守領域に属し、それを利用して種および種以下の分類階層を研究することができます。
| 製品タイプ | 研究対象 |
| 16s rDNA/rRNA | 細菌または古細菌 |
| 18s rDNA/RRNA | 真核生物 |
| ITSシーケンス | 真菌 |
| 機能遺伝子アンプリコンシーケンス | 特定の遺伝子のPCR産物をシーケンスする |
アンプリコンシーケンス研究対象
アンプリコンシーケンス技術の優位性：
識別効率の高さ：クローンまたは培養などの従来の識別方法と比較して、微生物群16S/18S/ITSシーケンスはより迅速で正確な方法です；
ダブルゾーン検出：1つ以上の可変領域に対する柔軟性があり、より長い配列読み取りが可能であり、コロニーをより正確に分析できます；
コストの低さ：メタゲノムシーケンスと比較して、シーケンス深度の要求が低く、コストパフォーマンスが高い；
高感度：極めて低い豊度の細菌を識別可能です。
アンプリコンシーケンス実験フロー：
アンプリコンシーケンス実験フロー
アンプリコンシーケンス分析フロー：
アンプリコンシーケンス分析フロー
アンプリコンシーケンスサービスの優位性：
経験豊富な技術者が、実験設計、サンプル検出、データ分析までの一連の専門サービスを提供できます；
フローが明確で、不必要なサンプルおよび時間の浪費を減らし、納品時間が短い；
異なる由来のサンプルに異なる抽出方法およびライブラリー構築シーケンス戦略を採用し、様々な環境研究のニーズに応えます；
百泰派克生物科技はプロテオーム、メタボロームなどの分析プラットフォームを有しており、多オミクス統合分析を行い、論文の質を向上させることができます。
アンプリコンシーケンスサンプル要件：
サンプルタイプ：メタサンプル、例えば糞便、土壌など、またはメタDNAサンプルはすべて検出可能です。具体的な要件については技術者にご相談ください。
アンプリコンシーケンスケーススタディ：
アンプリコンシーケンスケーススタディ
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