差異発現タンパク質統計分析

タンパク質の差異分析は、新しいバイオマーカーの発見を大いに促進し、バイオマーカーの特定の精度を向上させ、臨床疾患分析に重要な価値を持ちます。バイオパークは、統計データに基づいてより正確なタンパク質差異分析を提供し、異なる生理状態や異なる組織におけるタンパク質レベルの顕著な違いを発見することができます。差異発現タンパク質の統計過程では、FC≥1.3（または≤1/1.3）を差異タンパク質の統計基準として使用します。FC≥1.3のタンパク質は上方調節（up-regulation）とされ、FC≤1/1.3のタンパク質は下方調節（down-regulation）とされます。差異発現タンパク質の数を以下の表に示します：

 

差異発現タンパク質数統計表
Name	DiffExp	up-regulation	down-regulation
T56	765	310	455
WT6	585	235	350
注: Name: 差異発現組み合わせ名; DiffExp: 差異発現タンパク質数; up-regulation: 上方調節タンパク質数; down-regulation: 下方調節タンパク質数。

差異発現タンパク質数統計表

1. ベン図

ベン図を通じて、2つの差異組み合わせ間の共通および特有の差異発現タンパク質の数を明確に見ることができます：

図1 差異発現タンパク質ベン図

2. ボルケーノプロット

ボルケーノプロット（Volcano Plot）を通じて、2つの（グループ）サンプル間でのタンパク質発現レベルの差異と、その差異の統計的有意性を迅速に確認することができます。

図2 差異発現タンパク質ボルケーノプロット

注：差異発現ボルケーノプロットの各点は1つのタンパク質を表し、横軸はあるタンパク質が2つのサンプル間での発現量差異倍数の対数値を示します。縦軸はt検定のp値を示します。横軸の絶対値が大きいほど、2つのサンプル間での発現量倍数差異が大きいことを示し、縦軸の値が大きいほど、差異発現が顕著であり、選択された差異発現遺伝子の信頼性が高いことを示します。図中の緑色の点は差異発現下方調節タンパク質を、赤色の点は差異発現上方調節タンパク質を、黒色は非差異発現タンパク質を表します。