酵母非ターゲット脂質解析

出芽酵母（Saccharomyces cerevisiae）は、真核細胞の生理と分子イベントの研究に広く用いられているモデル生物です。酵母はトランスクリプトーム、プロテオーム、インタラクトームの研究を開拓するために使用され、酵母における脂質のリピドミクス分野は「酵母リピドミクス」と呼ばれています。他の真核細胞と比較して、出芽酵母は比較的単純なリピドームを持ち、これまでに約150種類の脂質分子が同定されています。出芽酵母は、保存された脂質代謝経路ネットワークを持っています。酵母には主に16または18の炭素原子を含む脂肪酸（FAs）が含まれており、これらのFAsは飽和（約20％）または一価不飽和（約80％）です。哺乳動物細胞と比較して、酵母にはC9とC10の間に二重結合を持つ一価不飽和脂肪酸のみが含まれており、これにより酵母脂質の組み合わせアシル鎖の複雑性が著しく低下します。

酵母の脂質代謝は、酵母における主要なステロールがコレステロールではなくエルゴステロールであるなど、いくつかの点で哺乳動物と異なります（エルゴステロールはC5（イソプレン）主鎖から一連の複雑な凝縮、環化、および酸化還元反応を通じて合成されます）。それでも、酵母モデルシステムは特定の脂質の合成、変換、局在、分解を制御するタンパク質を操作するための大きな機会を提供します。酵母細胞膜は、D-リモネンストレス、塩ストレス、低酸素ストレス、栄養ストレスなど、さまざまな種類のストレスに対して非常に敏感であることが示されています。膜リピドームの変化がストレス応答において重要な役割を果たすと推測されています。

質量分析技術の進歩に伴い、酵母リピドームはより正確かつ感度高く分析することができるようになりました。酵母リピドミクスの同定と定量に使用される機器には、MS、GC、HPLCまたはLC-MS、GC-MSが含まれます。GCやHPLCなどのクロマトグラフィー法とMSの組み合わせは、脂質分析のカバレッジを大幅に向上させることができます。酵母リピドミクスで広く使用されている分析技術の1つとして、LC-MSはPC、PE、PI、PS、PAおよびその他多くの脂質の定性的および定量的分析に使用されます。

酵母の非ターゲットリピドミクス

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酵母非ターゲット脂質解析

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