高スループット遺伝子ノックアウト後のプロテオミクス解析
プロテオミクスは、生物体内のすべてのタンパク質の構成、構造、機能、および相互作用を研究する科学分野であり、その目的は包括的なタンパク質リストを作成し、それらが生命過程で果たす役割を理解することです。しかし、現在十分に研究されている生物学的機能を持つタンパク質はまだ少なく、いくつかのタンパク質コード遺伝子には関連する注釈がありません。非同義一塩基多型、選択的スプライシング、および翻訳後修飾プロセスによって生成される大量のタンパク質タイプも、この研究をより困難にしています。ハイスループット遺伝子ノックアウト技術の登場により、大規模なタンパク質とタンパク質の形態検出が強力なツールとなりました。ハイスループット遺伝子ノックアウト技術は、特定の遺伝子をサイレンシングまたはノックアウトし、プロテオームの変化を観察するために使用されます。高分解能質量分析技術と組み合わせて、タンパク質の構成、修飾、および相対的な存在量を分析するために使用できます。
Dolgalev G,et al. Genes. 2021.
プロテオミクスにおけるハイスループット遺伝子ノックアウト技術の応用
ハイスループット遺伝子ノックアウト技術とプロテオミクスの組み合わせは、生物学研究に全く新しい視点を提供します。これら2つの技術を組み合わせることにより、研究者は特定の遺伝子ノックアウトがプロテオームに与える影響を研究し、ノックアウトされた遺伝子に関連するタンパク質を特定し、遺伝子とタンパク質の相互作用をよりよく理解し、タンパク質調節ネットワークを明らかにします。例えば、研究者は、特定の遺伝子のノックアウトが癌細胞内のタンパク質発現にどのように影響するかを特定し、新しい癌治療法を探すことができます。さらに、この組み合わせは、神経変性疾患、免疫疾患、代謝障害などのさまざまな疾患のメカニズムを研究するためにも使用できます。
バイテックパーカー バイオテクノロジー（BTP）は、高分解能プロテオミクス解析プラットフォームに基づき、ハイスループット遺伝子ノックアウト技術を組み合わせ、遺伝子ノックアウトからプロテオーム解析までの統合ソリューションを提供します。当社の最適化されたCRISPR/Cas9システムは、人/マウス細胞株、初代細胞、免疫細胞、およびiPS細胞の単一/複数遺伝子ノックアウト、フレームシフト変異、大規模シーケンスノックアウトを実現できます。ノックアウト（KO）細胞を取得した後、それを培養し、KO細胞が発現するタンパク質を抽出します。高分解能質量分析プラットフォームを使用してプロテオーム解析を実施し、タンパク質の構成とレベルの同定を通じて、特定のノックアウト遺伝子がタンパク質レベルに与える影響を解明し、遺伝子がタンパク質を調節するメカニズムを明らかにします。BTPは、7つの自主検査プラットフォームを持ち、CNAS/ISO9001の二重品質システム認証を取得した実験室を有しており、最も高品質な研究サービスを提供することを目的としています。私たちはあなたとの協力を期待しており、無料でお問い合わせいただき、より多くのサービスの詳細を知ることができます！
サービスの利点
ノックアウト効率保証：最適化されたCRISPR/Cas9システムにより、80%以上のターゲットノックアウト効率が70%を超えています。遺伝子ノックアウト後、サンガーシークエンシングと深層プロテオミクス技術を使用してノックアウト効率を二重に検証し、データの信頼性を二重に保証します。
完全なプロテオミクス解析プラットフォーム：当社のプロテオミクス解析プラットフォームは、完全なサンプル前処理装置、高特異性タンパク質修飾濃縮プラットフォーム、超高性能液体クロマトグラフィー高分解能質量分析連携装置、およびタンパク質N末端シーケンス分析装置を備えており、オミクスレベルでタンパク質の効率的な抽出、特定の修飾ペプチドの効率的な濃縮、タンパク質の同定、相対定量（3D & 4D）および絶対定量分析を実現し、KO細胞が発現するプロテオームを全面的に分析できます。
プロジェクト期間の短縮：遺伝子ノックアウト実験を行う前に、異なる細胞での遺伝子の必要性と発現量を分析し、実験の実行可能性を確保し、実験失敗のリスクを低減します。また、クライアントのターゲットに対して予備実験を行ってgRNAを検証する必要がなく、プロジェクト期間を大幅に短縮しました。
ワンストップサービス：BTPは、豊富なオミクスサービスの経験と専門の技術者を有しており、ご要望に応じて最適なプロジェクトプランをカスタマイズできます。あなたは実験の目的を私たちに伝え、サンプルを送るだけで、BTPがすべてのプロジェクトの後続処理を担当します。これには、サンプル処理、実験分析、データ分析、プロジェクトレポートが含まれます。
応用分野
1.疾患メカニズム研究
特定の遺伝子をノックアウトすることにより、研究者は疾患状態でのタンパク質発現と調節の変化を観察できます。例えば、がん研究では、がんの進行に関連する遺伝子をノックアウトすることで、腫瘍の生物学的メカニズムをよりよく理解できます。
2.薬物ターゲット発見
遺伝子ノックアウトがプロテオームに与える影響を分析し、新しい薬物ターゲットを特定します。例えば、アルツハイマー病の新しい治療薬を探す際に、認知機能の低下に関連する遺伝子をノックアウトすることで、潜在的な治療ターゲットを特定できます。
3.機能ゲノミクス研究
遺伝子ノックアウト技術とプロテオミクスを組み合わせて、細胞内の遺伝子とタンパク質の機能を研究し、それらが生物学的プロセスを調節するためにどのように相互作用するかを調べます。
4.システム生物学
システム生物学分野では、遺伝子ノックアウト技術とプロテオミクスを組み合わせてタンパク質-タンパク質相互作用ネットワークを構築し、複雑な生物システムを理解するのに役立ちます。例えば、特定の病理条件下でのプロテオーム変化を分析することで、疾患過程における重要な調節ネットワークを明らかにします。
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