プロテオミクスデータの品質評価

プロテオミクス質量分析データはプロテオミクス解析の基盤であり、質量スペクトルの質は検索解析結果の精度と密接に関連しています。そのため、プロテオミクスデータの品質評価は非常に重要です。バイタイパークは、バイオインフォマティクス解析の信頼性を確保するために、以下の4つの観点から同定されたプロテオームデータの品質評価を行います。

1. ペプチドマッチング誤差分布
2. ペプチド数の分布
3. ペプチド長の分布
4. タンパク質分子量の分布

1. ペプチドマッチング誤差分布分析

全ての一致したペプチドの相対分子量の実測値と理論値の間の誤差分布は以下の図に示されています。

図1 ペプチドマッチング誤差分布図

2. ペプチド数分布分析

同定されたタンパク質に含まれるペプチド数の分布状況は以下の図に示されています。

図2 ペプチド数分布図

注：横軸はペプチド数の範囲、縦軸はタンパク質の数です。

3. 同定されたペプチド長の分布分析

同定されたペプチド長の分布図は以下の通りです。

図3 ペプチド長分布図

注：横軸はペプチド長の分布、縦軸はペプチド数です。

4. タンパク質分子量分布分析

図4 タンパク質分子量分布図

注：横軸はタンパク質の分子量範囲、縦軸はタンパク質の数です。