単一細胞シーケンシングの際、組織を原代細胞培養することができ、細胞が一定量に達してから検査に出すことはできますか?
単一細胞シーケンシング実験では、原組織から直接細胞を分離することが最適な選択肢であり、初代細胞培養後に検査するのではありません。これは主に、細胞培養が以下の問題を引き起こし、単一細胞シーケンシング結果の正確性と信頼性に影響を与えるためです:
- 培養により細胞の異質性が失われる可能性がある。
- 培養条件が細胞の遺伝子発現プロファイルを変える。
- 汚染リスクと背景ノイズが増加する。
推奨される処理方法:
1、優先的に組織から単一細胞を直接分離する
(1)酵素消化または機械的分離によって単一細胞懸濁液を得る。
(2)細胞の状態変化を避けるために、すぐにシーケンシングを行う。
2、特別な場合には短期間の培養が可能
(1)培養が必要な場合、時間は24-48時間以内に制御し、培養条件を厳密に最適化する。
(2)培養前後のサンプルを比較して、遺伝子発現の差異を評価する。
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