細胞内プロテオミクス研究
サブセルラープロテオミクスは、細胞膜、ミトコンドリア、ゴルジ体、細胞核など、特定の細胞領域におけるプロテオームをターゲットとした研究を指します。百泰派克バイオテクノロジーは、質量分析に基づくサブセルラープロテオミクス分析サービスを提供しています。
サブセルラープロテオミクス
サブセルラープロテオミクスは、細胞内の異なる領域や構造機能単位におけるプロテオームの研究を指します。全細胞プロテオミクス(12,000〜40,000種類のタンパク質を含む)に比べ、現在のプロテオミクス分析技術とツールは、サブセルラープロテオミクス(500〜4,000種類のタンパク質を含む)に適しています。サブセルラーとは細胞小器官または細胞領域を指し、細胞膜、細胞質、ミトコンドリア、リソソーム、ペルオキシソーム、エンドプラズミックレティキュラム、ゴルジ体、細胞核などが含まれます。サブセルラープロテオミクス研究の意義は、低濃度タンパク質の濃縮、全細胞プロテオームの補完、タンパク質のサブセルラー局在情報の提供、細胞の分子メカニズムの理解の深化が可能になることです。
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サブセルラープロテオミクスのサンプル要件
プロテオミクス研究において、サンプルの種類、実験の目的、分析方法に応じて、サンプルの調製方法は異なります。サブセルラープロテオミクス研究では、サンプルの効果的な前処理と高純度のサブセルラー成分の分離がサンプル調製の鍵です。特にその後に質量分析を使用してタンパク質を分析する場合、サブセルラープロテオミクスのサンプル中のタンパク質の純度を確保し、研究目的以外の他のサブセルラープロテオミクスの干渉を避ける必要があります。質量分析の感度が高いため、汚染タンパク質が分析結果の正確性に影響を与える可能性があります。異なるサブセルラープロテオームに対しては、相応しい方法でタンパク質を分離抽出する必要があります。例えば、バイオチン標識は、サブセルラープロテオミクスにおける細胞膜プロテオミクスの高純度膜タンパク質を分離する方法の一つです。
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