糖基化ペプチド分析
糖鎖化は、一般的なタンパク質の翻訳後修飾（Post-translational Modification, PTM）であり、タンパク質の機能と安定性に重要な影響を与えます。糖鎖化ペプチドとは、糖鎖がペプチドに結合した形式で、ペプチドのアミノ酸情報、完全な糖鎖情報、糖鎖とペプチドの結合部位の情報を含みます。糖鎖化ペプチド分析はタンパク質機能調節、薬物開発、生物工学、バイオ医薬品など研究分野で広く応用されている技術で、分析糖鎖化ペプチドは、糖鎖化ペプチドの質量、電荷状態、結合位置、糖鎖構造などの詳細な情報を提供できます。，糖鎖化調節のメカニズムを深く理解するためにも重要な意義を持っています。
図1 糖鎖化分析フロー図
バイタイパーク生物科技BTPCNAS/ISO9001の二重品質システム認証を取得しています。会社は液体クロマトグラフィー-質量分析法を基にした高分解能質量分析プラットフォームを開発し、特定の糖タンパク質の完全な意味での糖鎖化分析方法を提供します。高品質なワンストップ糖鎖化ペプチド分析サービスを提供し、糖鎖化修飾の種類、糖鎖化部位の修飾効率、糖鎖化部位の様々な糖型の割合を正確に解析します。。無料相談を歓迎し、詳細についてはお問い合わせください！
実験機器
- NanoLC: Vanquish NEO
- MS: Orbitrap Fusion Lumos With ETD
技術応用
糖鎖化ペプチドの分析は、特定の糖タンパク質の包括的な糖鎖化分析を実現し、得られる情報は以下を含みます：
1. 糖鎖化部位の特定、すなわちタンパク質中のどの部位が糖鎖化修飾を受けたか；
2. N糖鎖化部位とO糖鎖化部位を区別し、糖鎖修飾のタイプを特定；
3. 各N糖鎖化部位に対応する糖鎖の構成、構造、相対含量情報を取得；
4. 各O糖鎖化部位に対応する糖鎖の構成と相対含量情報を取得；
上記の情報を統計と要約し、糖タンパク質の糖鎖化特性をさらに分析し解釈することができます。
ケース示意
1.糖鎖化修飾の種類
| Type | Position | Glycans NHFAGNa | Modification Type(s) | Score | Intensity | Percentage(%) |
| N-Glyco | 15 | HexNAc(5)Hex(3)Fuc(1) | N[+1648] | 531.64 | 392950000 | 64.56 |
| HexNAc(2)Hex(7) | N[+1541] | 521.07 | 215691739 | 35.44 | ||
| 26 | HexNAc(2)Hex(5) | N[+1216] | 596.96 | 3825409478 | 66.12 | |
| HexNAc(2)Hex(8) | N[+1703] | 437.45 | 1214599000 | 21.00 | ||
| HexNAc(2)Hex(6) | N[+1378] | 426.73 | 745143899 | 12.88 | ||
| 75 | HexNAc(2)Hex(5) | N[+1216] | 685.20 | 4125796520 | 100.00 | |
| 103 | HexNAc(2)Hex(5) | N[+1216] | 744..04 | 2256398640 | 48.81 | |
| HexNAc(2)Hex(8) | N[+1703] | 623.99 | 1154076000 | 24.96 | ||
| HexNAc(2)Hex(7) | N[+1541] | 601.27 | 1212540000 | 26.23 | ||
| 116 | HexNAc(2)Hex(5) | N[+1216] | 528.10 | 188561000 | 100.00 | |
| O-Glyco | 41 | HexNAc(2)Hex(3)Fuc(1) | T[+1038] | 563.23 | 314565000 | 100.00 |
| 67 | HexNAc(3)Hex(3)Fuc(1) | S[+1241] | 702.63 | 15243000 | 100.00 | |
| 133 | HexNAc(2)Hex(3)Fuc(1) | S[+1038] | 628.96 | 632560000 | 47.82 | |
| HexNAc(4)Hex(3)Fuc(1) | S[+1445] | 476.50 | 654870000 | 49.51 | ||
| HexNAc(6)Hex(3)Fuc(1) | S[+1851] | 411.28 | 35254313 | 2.67 |
表1 糖鎖化修飾タイプの統計
注：Type：糖鎖化修飾のタイプ；Position：糖鎖化部位のタンパク質内の位置；Glycans NHFAGNa：糖鎖化修飾の糖型；Modification Type(s)：糖型の分子量；Score：タンパク質のスコア値；Intensity：タンパク質の相対的な豊度；Percentage %：各自の対応する部位の総糖型中でのその糖型の割合。
2.糖鎖化部位修飾効率
図2 糖鎖化効率の統計図
注：糖鎖化効率（%）=（同一部位に含まれる糖鎖化ペプチドの相対含量の合計/糖鎖化を含まないペプチドの相対含量の合計）* 100
3.各糖鎖化部位の様々な糖型の割合
図3 糖型の割合
注：図中の横軸は糖型、縦軸は糖型の割合で、ある部位に含まれるN糖の糖型とその割合を示しています。
4.タンパク糖鎖化修飾情報の総合図
図4 糖鎖化情報の総合
注：図中では各部位における含量上位3位の糖を示しています。
中/英語プロジェクトレポート
技術レポートには、バイタイパークが詳細な中英二言語版技術レポートを提供し、レポートには以下が含まれます：
1. 実験手順（中英）
2. 関連する質量分析パラメータ（中英）
3. 糖鎖化ペプチド分析詳細情報
4. 質量分析画像
5. 元データ
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