糖鎖化部位及びその部位の糖型分析

タンパク質の糖鎖修飾は、タンパク質の立体構造、生物活性、輸送および局在に影響を与えるだけでなく、分子認識、細胞間コミュニケーション、シグナル伝達などの特定の生物学的プロセスにおいても重要な役割を果たします。したがって、糖鎖修飾部位およびその部位の糖型分析は非常に重要な意義を持っています。

百泰派克社は、LC-MS/MSを用いた糖鎖修飾部位およびその部位の糖型分析サービスを提供しています。通常、まず複数の酵素を選択してターゲットタンパク質を酵素消化し、できるだけ完全にターゲットタンパク質の配列をカバーします。次に、糖鎖を酵素切断した後、タンパク質中の糖鎖修飾部位を分析します。糖鎖修飾が行われたペプチドを特定した後、再度ターゲットタンパク質を酵素消化し、ペプチド上の糖鎖を保持してLC-MS/MS分析を行います。ETD\HCD\CIDの組み合わせによるフラグメンテーション方式を用いて、できるだけ豊富なペプチド二次フラグメンテーション情報を取得します。糖鎖修飾ペプチドの二次スペクトルをソフトウェア分析および手動で識別することにより、ターゲットタンパク質中の糖鎖修飾部位およびその部位の糖型に関する正確な情報を得ることができます。

Gashash, E. A. et al. J Proteome Res. 2017.

糖鎖修飾部位および糖型分析プロセス

糖鎖修飾部位および糖型分析

技術的特徴

• ターゲットタンパク質中の糖鎖修飾部位に対応する糖型を正確に分析します
• 検出感度が高く、再現性が良い

応用分野

• 糖鎖修飾タンパク質中のN-糖鎖修飾部位に対応する糖型を特定する
• 糖鎖修飾タンパク質中のO-糖鎖修飾部位に対応する糖型を特定する

サンプルについて

サンプルタイプ	タンパク質	細胞サンプル	動物組織	植物組織	血液 (EDTA抗凝固)	血清	尿	酵母、微生物サンプル
サンプル量	100 ug	1X10⁷個の細胞	1 g	200 mg	1 mL	0.2-0.5 mL	2 mL	乾燥重量200 mg

糖鎖修飾部位および糖型分析サンプルの要件

1. 組織サンプルを提供する場合は、ドライアイスで組織サンプルをお送りください。
2. タンパク質サンプルを提供する場合は、普通の組織、細胞溶解液を使用してタンパク質を抽出してください。
3. サンプル輸送：十分なドライアイスを使用して輸送し、できるだけ速い配送方法を選択して、輸送中のサンプルの分解の可能性を減らしてください。