糖基化定量蛋白組學研究

BTP-糖鎖化定量プロテオミクス研究

糖鎖化修飾は、タンパク質の立体構造、生物活性、輸送および局在性に影響を与えるだけでなく、分子認識、細胞間コミュニケーション、シグナル伝達などの特定の生物学的プロセスにおいて重要な役割を果たしています。糖タンパク質はその糖鎖構造および糖鎖化部位に基づいて主にN-糖タンパク質とO-糖タンパク質の2つのタイプに分類されます。推定では、50%以上のタンパク質が糖鎖化修飾を受けているとされていますが、糖鎖化の高度な複雑性のため、ほとんどの糖タンパク質はまだ発見されておらず、現有のデータベースでは約10%のタンパク質のみが糖タンパク質として注釈されています。6種類の異なる単糖からなるオリゴ糖鎖の構造は、驚異的な10^12種類に達する可能性があります。
百泰派克社は、Thermo FisherのQ Exactive HF質量分析プラットフォーム、Orbitrap Fusion質量分析プラットフォーム、Orbitrap Fusion Lumos質量分析プラットフォームにNano-LCを組み合わせ、糖鎖化定量プロテオーム解析サービスパッケージを提供しています。お客様は実験目的をお知らせいただき、サンプルをお送りいただくだけで、プロジェクトのその後のすべての手続きを私たちが担当します。これには、タンパク質抽出、プロテアーゼ消化、糖鎖化ペプチドの濃縮、ペプチドの分離、質量分析、質量分析の生データ解析、生物情報学解析が含まれます。

質量分析の分解能の向上と生物情報学の進展により、質量分析は糖鎖化解析に広く応用されています。通常、酵素消化または化学的手段を用いて糖鎖を糖タンパク質から解放し、糖鎖化部位の同定と糖鎖構造の解析をそれぞれ行います。しかし、完全な糖ペプチドの解析には成熟した技術がまだありません。百泰派克社は新世代の組み合わせ型質量分析装置であるOrbitrap FusionのHCD/ETD「二重解裂モード」を用いて複雑な糖タンパク質の完全な糖ペプチドを解析し、Byonicソフトウェアを使用して質量分析の生データを解析し、N-糖鎖化部位とO-糖鎖化部位の同定を実現し、対応する部位に付随する糖鎖の構成を分析します。

糖鎖化修飾研究ルート

サンプルについて

1. 組織サンプルを提供される場合、ドライアイスで組織サンプルをお送りください。植物組織サンプルは200mg以上、血液サンプルは少なくとも1ml（血漿にはEDTAで抗凝固処理）、血清は0.2-0.5ml、尿は2ml、動物組織サンプルは少なくとも1g、細胞サンプルは1X10^7個の細胞、酵母、微生物などの乾燥重量は200mgです。
2. タンパク質サンプルを提供される場合、タンパク質の総量が100ug以上であることを確認してください。タンパク質抽出時には通常の組織、細胞破砕液を使用してください。
3. サンプルの輸送：十分な量のドライアイスを使用して輸送し、輸送中のサンプルの劣化を抑えるためにできるだけ早い郵送方法を選択してください。

研究ケース

このプロジェクトは、ある大学の先生が百泰派克で植物サンプルを用いてタンパク質糖鎖化修飾部位の同定を行ったものです。得られた一部の結果は以下の図に示されています：

糖鎖化修飾研究ケース

中/英語プロジェクトレポート

技術レポートでは、百泰派克は詳細な中英バイリンガル技術レポートを提供します。レポートには以下が含まれます：

1. 実験手順（中英）
2. 関連する質量分析パラメータ（中英）
3. 同定された糖鎖化部位の詳細情報
4. 質量分析画像
5. 生データ

BTP-糖鎖化定量プロテオミクスワンストップサービス

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