ラベルフリー定量プロテオーム分析

ラベルフリー定量技術は、タンパク質の酵素消化ペプチドを液体クロマトグラフィーと質量分析を組み合わせた技術で分析し、高価な安定同位体ラベルを内部標準として使用せずに、タンパク質の大規模な同定において生成される質量分析データを比較し、異なるサンプル中の対応するペプチドの信号強度を比較することで、ペプチドに対応するタンパク質の相対的な定量を行う技術です。

基づいてSILACとiTRAQの定量プロテオミクス研究技術は、最初にタンパク質をラベル化し、質量分析を行います。提供されるタンパク質定量情報は非常に多いですが、ラベル試薬は高価で、各サンプルのコストが高いため、全体的なプロテオームレベルでのタンパク質の発現変化を定量的に分析するのに適しています。co-IPのサンプルのような比較的単純なタンパク質混合物の場合、コストパフォーマンスは低く、翻訳後修飾のプロテオミクス研究、例えばユビキチン化研究においては、ユビキチン化自体がリジンの側鎖で発生するため、ユビキチン化ペプチドの濃縮はリジン側鎖に残る2つのグリシン（gly-gly）に対する抗体を用いて行われますが、iTRAQ試薬のラベル化はこの濃縮プロセスに大きな影響を与えるため、組織サンプルのユビキチン化修飾をプロテオームレベルで分析する際にはiTRAQラベル化技術を使用できません。ラベルフリー定量分析技術はこの実験ニーズに基づいて確立された定量プロテオミクス技術です。同じペプチドは質量分析中にイオン化効率が同じであり、質量分析ピークの面積はそのペプチド量を直接表すため、同じペプチドの質量分析ピーク面積を比較することで、そのペプチドが代表するタンパク質の相対定量情報を直接得ることができます。

バイオタイパーク社は、Thermo FisherのQ ExactiveHF質量分析プラットフォーム、Orbitrap Fusion質量分析プラットフォーム、Orbitrap Fusion Lumos質量分析プラットフォームとNano-LCを組み合わせた、ラベルフリーに基づく定量プロテオミクス分析サービスを提供しています。お客様は実験の目的を知らせていただき、細胞を送っていただくだけで、以降のプロジェクトすべてを弊社が担当いたします。これには細胞培養、細胞ラベル化、タンパク質抽出、酵素消化、ペプチド分離、質量分析、質量分析の生データ分析、生物情報学分析が含まれます。

ラベルフリー定量プロテオミクス分析のプロセス

ラベルフリー定量プロテオミクスサービスのプロセス

サンプルについて

1. co-IPサンプルを提供する場合、タンパク質の必要量は約2-5µgであり、送付するタンパク質サンプルには洗剤（例：SDS）や高い酸素濃度を含めないでください。または、タンパク質サンプルを含むビーズを直接弊社に送付していただき、以降の実験を弊社が担当いたします。
2. 組織サンプルを提供する場合、ドライアイスで組織サンプルを送ってください。動物サンプルは200mg以上、血液サンプルは少なくとも1ml（血漿にはEDTAを使用して抗凝固）、血清は0.2-0.5ml、尿は2ml、植物サンプルは少なくとも1g、細胞サンプルは1X10^7個、酵母や微生物などの乾燥重量は200mgです。
3. タンパク質サンプルを提供する場合、タンパク質の総量が50µg以上であることを確認してください。タンパク質抽出には通常の組織・細胞の裂解液を使用してください。
4. サンプルの輸送：十分な量のドライアイスを使用して輸送し、できるだけ早い郵送方法を選択して、輸送中のサンプルの劣化の可能性を低減してください。

中/英語プロジェクトレポート

技術レポートでは、バイオタイパークが詳細な中英バイリンガル版技術レポートを提供します。このレポートには以下が含まれます：

1. 実験手順（中英）
2. 関連する質量分析パラメータ（中英）
3. 質量分析画像
4. 生データ
5. タンパク質差異レベル分析
6. 生物情報学分析

ラベルフリー定量プロテオミクスのワンストップサービス

注文するだけでサンプルを送付
バイオタイパークがワンストップサービスを完了：サンプル処理-機器分析-データ分析-プロジェクトレポート

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