SWATH定量プロテオミクスサービス

SWATH（Sequential Window Acquisition of all Theoretical fragment ions）は、ETH ZürichのDr. Ruedi AebersoldチームとAB SCIEXが共同で開発した新しい質量分析取得モード技術です。SWATHはDIA (Data Independent Acquisition)技術として、全質量分析スキャン範囲をいくつかの小窓に分割し、各窓のすべてのイオンを順次フラグメント化することで、スキャン範囲内のすべてのペプチドイオンを高速で一次MSスキャンを行い、その後二次MS/MS分析を行います。そのため、SWATHは複雑なサンプル中のほぼすべての検出可能な分子を定量的に測定することができます。SWATHは、shotgun proteomicsの高スループット検出の特徴と正確な定量分析の利点を統合しており、真の意味でのパノラマ質量分析検出手段であるMS/MS ALLです。百泰派克社は、AB SCIEX Triple-TOF 5600 plus高分解能質量分析システムを採用し、迅速なスキャン速度と連動した四重極質量分析システムの定量的感度能力を持ち、質量分析システムの高分解能、正確な質量数安定性、高感度および高速スキャンの特徴を兼ね備え、SWATH定量プロテオミクス分析サービスパッケージを提供しています。サンプルを送っていただければ、プロジェクトの後続作業（タンパク質抽出、プロテアーゼ消化、ペプチド分離、質量分析、質量分析生データ分析、生物情報学分析）をすべて担当いたします。

SWATH定量プロテオミクスサービスプラットフォーム

SWATH定量プロテオミクスサービスプラットフォーム

SWATH技術の特徴

• 複雑なサンプル中のすべての分子を定量的に同定、低濃度のタンパク質やペプチドも含む
• 定量精度が高い：定量精度はMRM技術に匹敵
• 高スループット：1回の実験で2,000種類以上のタンパク質を定量検出可能
• 完全で包括的な情報の保存が可能、MS、MS/MSの各ピークデータを保存し、同一サンプルを再検査する必要がありません
• MRM技術のように事前にサンプル測定方法を調整する必要がありません

SWATH/DIAの利点の紹介

複雑なサンプルの定量分析の主な問題は、サンプル自体の高濃度タンパク質の干渉により、低濃度タンパク質の同定が難しい点にあります。多くのDDA(Data Dependent Acquisition)質量分析同定方法では、MSレベルでペプチドを同定し、MS信号が強いペプチドを優先的に選択して二次フラグメント化を行うため、低濃度のペプチドは二次分析に選ばれにくいです。しかし、SWATH/DIAはサンプル中のすべての分子を無差別に分析し、すべてのペプチドのMS、MS/MSデータを一度に保存することで、重要なデータが見落とされないようにします。総じて、SWATHは定量分析の信頼性を大いに向上させ、複雑なサンプル中の極めて低濃度のタンパク質分子を効率的に測定できます。

DDAとSWATH/DIA質量分析の比較

さらに、比較してMRM検出対象の分子に基づいて検出方法を最適化する必要があるのに対し、SWATHは偏りなくすべての分子を分析し、検出方法を事前に最適化する必要がありません。取得済みの検出データを基に分析方法を最適化するだけで済みます。そのため、SWATH分析は分析期間を大幅に短縮できます。