MRM/PRM定量プロテオミクス分析
MRM(マルチプルリアクションモニタリング)は、標的タンパク質分子のターゲット定量プロテオミクス研究方法です。MRMは標的分子の情報に基づいてデータを選択し、質量分析データを収集します。標的イオン規則に適合する信号を収集し、規則に適合しないイオン信号の干渉を排除します。MRM質量分析は3つの段階を経て行われます:1、標的分子に特異的に一致する母イオンをMSで選択します。2、これらの母イオンを衝突によって破壊し、他のイオンの干渉を排除します。3、選定した特異的MS/MS2イオンのみの質量分析信号を収集します。MRM質量分析技術は高精度なタンパク質定量識別技術であり、複雑なサンプル中の複数の標的タンパク質を一度に正確に定量するための優れた方法です。同位体標識された標的ペプチドを内部標準として使用することで、タンパク質の絶対定量識別が可能になります。
バイタイパーク社はAB SCIEX TripleTOF 5600、AB SCIEX Triple Quad™ 5500、Q Exactive、Fusion質量分析プラットフォームとNano-LCを組み合わせて、MRM/PRMターゲット定量プロテオミクス分析サービスパッケージを提供しています。研究対象のタンパク質情報を提供するだけで、MRM定量タンパク質分析サービスをワンストップで提供します。MRM方法の確立と最適化、特異的ペプチドの選択、同位体標識ペプチド、質量分析、元データ分析、生物情報学分析を含みます。
BTP-MRM/PRM定量プロテオミクス分析プラットフォーム
AB SCIEX TripleTOF 5600,AB SCIEX Triple Quad™ 5500,Q Exactive, Fusion
MRM/PRM定量プロテオミクス分析実験フロー
MRM-PRM定量プロテオミクス分析実験フロー
MRM-PRM定量プロテオミクス分析実験フロー2
MRM技術の特徴
• 高感度で、2段階の質量分析で標的イオンと一致するイオンを選択し、干渉イオンを排除することで信号対雑音比を大幅に向上させ、標的イオンの検出精度を高めます。
• 高スループットで、一度に200以上のタンパク質を識別できます。
• 絶対定量分析が可能で、抗体に依存しません。
• 低豊度タンパク質の高精度識別が可能で、定量範囲は4桁の数量級にわたります。
MRM技術の応用分野
• Label-freeなどの非ターゲットタンパク質群研究結果の検証
• 複数のタンパク質/ペプチドを同時に絶対定量研究
• 同一性が高いが特異的識別抗体が不足しているタンパク質ファミリーの変化を研究
• タンパク質翻訳後修飾の定量研究
• 生物疾病ターゲットの絶対定量研究
MRM分析サンプルの要求
MRM-PRM定量プロテオミクス分析サンプルの要求
MRM技術サービスの生物情報学分析
• MRMスペクトル分析、タンパク質データの品質評価
• 多成分サンプルのPCA分析
• 識別されたタンパク質の機能注釈:GO機能注釈、KEGG機能注釈、COG機能注釈
• 差異発現タンパク質の統計分析:ヴェン図、火山図(Volcano Plot)
• 差異発現タンパク質のクラスタリング分析:階層クラスタリング、K-meansクラスタリング
• 差異タンパク質相互作用分析:STRINGデータベースに基づくタンパク質相互作用ネットワーク分析
SRM/MRMの応用
• iTRAQ差異タンパク質の検証;
• ラベルフリー差異タンパク質後続生成物の検証;
• ペプチドとタンパク質の絶対定量;
• 疾病指標の定量化、診断モデルの構築;
• リン酸化タンパク質の定量、メチル化タンパク質の定量;
• その他の翻訳後修飾タンパク質の定量;
• パスウェイ定量分析。
中/英語プロジェクト報告
技術報告書では、バイタイパーク社は詳細な中英二言語版技術報告書を提供し、報告書には以下が含まれます:
1. 実験手順(中英)
2. 関連する質量分析パラメータ(中英)
3. 質量分析画像
4. 元データ
5. タンパク質差異レベル分析
6. 生物情報学分析
MRM定量プロテオミクスワンストップサービス
注文-サンプル送付だけでOK
バイタイパーク社のワンストップサービスで完了:サンプル処理-機器分析-データ分析-プロジェクト報告
関連サービス
平行反応監視PRMサービス
DIA-PRMプロテオミクス
絶対定量分析(AQUA)
ターゲットプロテオミクス
定量プロテオミクス分析
4Dプロテオミクス
翻訳後修飾プロテオーム分析
Label Freeに基づく定量プロテオーム分析
タグベースのタンパク質定量技術-iTRAQ、TMT、SILAC
TMT/iTRAQ/MultiNotch定量プロテオミクス分析
DIA定量プロテオミクス
SWATH定量プロテオミクスサービス
2D-DIGE定量プロテオミクス
プロテオミクス生物情報学分析
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