パラレル反応モニタリングPRMサービス
平行反応モニタリング(PRM)は、高分解能・高精度の質量分析によるイオンモニタリング技術です。PRM技術の原理はSRM/MRMの原理に似ていますが、分析方法の開発において、PRMは主にタンパク質とペプチドの絶対定量に使用されます。PRM技術は複雑なサンプル中のアトモールレベルの多種類のタンパク質を検出することができます。
PRMはQ-Orbitrapを基盤とした四重極高分解能質量分析検出プラットフォームです。SRMが毎回一度の遷移を実行するのとは異なり、PRMは前駆体イオンにより全スキャンを行います。つまり、前駆体イオンのすべてのフラグメントを同時にモニタリングします。まず、PRMは四重極(Q1)を使用して前駆体イオンを選択し、選択範囲は一般的にm/z ≤ 2です。次に、前駆体イオンは衝突セルで破砕されます(Q2)。最後に、OrbitrapがQ3を置き換え、高分解能と高精度で破砕されたすべてのイオンをスキャンします。したがって、PRM技術はSRM/MRMの定量分析能力だけでなく、定性能力も備えています。
2.生成物イオンの全スキャンを行い、イオンペアを選択する必要がないため、分析方法の構築が容易です。
3.幅広い線形範囲:5〜6桁まで増加します。
• 高スループット;
• 分析方法の開発がより容易。
2.質量分析:加水分解されたサンプルを使用し、Thermo社の最新のObitrap Fusion Lumos質量分析計でサンプルを質量分析します。
3.データ分析:Skylineソフトウェアを使用してデータ分析を行います。
• ラベルフリー無標識差異タンパク質の検証;
• ペプチドとタンパク質の絶対定量;
• 疾病指標の定量化、診断モデルの構築;
• リン酸化タンパク質定量、メチル化タンパク質定量;
• その他の翻訳後修飾タンパク質定量;
• 代謝経路定量分析。
平行反応モニタリング(PRM)
PRMはQ-Orbitrapを基盤とした四重極高分解能質量分析検出プラットフォームです。SRMが毎回一度の遷移を実行するのとは異なり、PRMは前駆体イオンにより全スキャンを行います。つまり、前駆体イオンのすべてのフラグメントを同時にモニタリングします。まず、PRMは四重極(Q1)を使用して前駆体イオンを選択し、選択範囲は一般的にm/z ≤ 2です。次に、前駆体イオンは衝突セルで破砕されます(Q2)。最後に、OrbitrapがQ3を置き換え、高分解能と高精度で破砕されたすべてのイオンをスキャンします。したがって、PRM技術はSRM/MRMの定量分析能力だけでなく、定性能力も備えています。
PRMの利点
1.質量精度がppmレベルに達し、SRM/MRMよりも背景干渉と偽陽性問題をより効果的に除去し、複雑な背景下での検出限界と感度を向上させます。2.生成物イオンの全スキャンを行い、イオンペアを選択する必要がないため、分析方法の構築が容易です。
3.幅広い線形範囲:5〜6桁まで増加します。
SRM/MRM技術の利点
• 高感度;• 高スループット;
• 分析方法の開発がより容易。
百泰派克生物科技による平行反応モニタリングPRM分析の主な流れ:
1.PRM分析法の開発:まず、質量分析ライブラリから生成するかSkylineソフトウェアから2種類または3種類のターゲットペプチドを選択します。選択されたペプチドはターゲットタンパク質に特有で、LC-MSによる検出が容易で、切断部位の欠失や多重修飾されたアミノ酸がないことが必要です。次に、x軸-濃度比、y軸-ピーク面積比に基づいて標準曲線を構築します。2.質量分析:加水分解されたサンプルを使用し、Thermo社の最新のObitrap Fusion Lumos質量分析計でサンプルを質量分析します。
3.データ分析:Skylineソフトウェアを使用してデータ分析を行います。
PRMの応用
• iTRAQにおける差異タンパク質の検証;• ラベルフリー無標識差異タンパク質の検証;
• ペプチドとタンパク質の絶対定量;
• 疾病指標の定量化、診断モデルの構築;
• リン酸化タンパク質定量、メチル化タンパク質定量;
• その他の翻訳後修飾タンパク質定量;
• 代謝経路定量分析。
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