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リン酸化定量プロテオミクス研究

BTP-リン酸化定量プロテオミクス研究

リン酸化修飾はシンプルで柔軟かつ可逆的な特性を持ち、リン酸基の供与体であるATPが容易に得られるため、真核細胞における一般的な調節手段です。タンパク質のリン酸化と脱リン酸化という可逆過程は、細胞の増殖、発育、分化、細胞骨格の調節、細胞死、神経活動、筋肉の収縮、新陳代謝、腫瘍発生など、生命活動のほぼすべてのプロセスを調整しています。

リン酸化修飾されたタンパク質は生体試料中で含量が低く、動的範囲が広いため、定量プロテオミクス分析手法を用いて富集したリン酸化ペプチドサンプルを定量分析する前に、修飾を富集して修飾タンパクの豊度を向上させる必要があります。百泰派克は実験の必要に応じて、固相金属親和性クロマトグラフィー(IMAC)、リン酸化抗体富集、TiO2富集を選択し、効率的なサンプル富集を実現しています。また、ペプチドの富集過程において、単リン酸化ペプチドと多リン酸化ペプチドを段階的に分離し、それぞれを質量分析にかけることで、質量分析過程でのイオン化効率の問題による単リン酸化ペプチドの同定と定量への影響を回避しています。

百泰派克はThermo FisherのQ ExactiveHF質量分析プラットフォーム、Orbitrap Fusion質量分析プラットフォーム、Orbitrap Fusion Lumos質量分析プラットフォームをNano-LCと組み合わせて使用し、リン酸化定量プロテオミクス分析サービスパッケージを提供しています。実験目的をお知らせいただき、サンプルを送っていただくだけで、百泰派克がプロジェクトの後続処理を担当します。これには、タンパク質抽出、タンパク質酵素切断、リン酸化ペプチド富集、ペプチド分離、質量分析、質量分析の生データ解析、生物情報学解析が含まれます。

BTP-リン酸化定量プロテオミクス分析フロー

磷酸化定量蛋白组学分析流程

 

リン酸化定量プロテオミクス分析フロー

 

BTP-リン酸化定量プロテオミクスサンプル要件

1. 組織サンプルを提供する場合、ドライアイスで組織サンプルを送ってください。植物組織サンプルは200mg以上、血液サンプルは最低1ml(血漿はEDTAで抗凝固)、血清0.5ml、尿2ml、動物組織サンプルは最低1g、細胞サンプルは5X10^7個の細胞、酵母、微生物などの乾燥重量200mg。
2. タンパク質サンプルを提供する場合、タンパク質の総量が1mg以上であることを保証してください。タンパク質抽出時は通常の組織、細胞溶解液を使用してください。
3. サンプル輸送:十分な量のドライアイスを使用し、できるだけ速い配送方法を選択して、輸送中のサンプルの劣化を防ぐようにしてください。
4. 正式な実験の前に、提供されたサンプルを検査し、検査が合格した後に正式な試験を開始します。

BTP-リン酸化定量プロテオミクス研究事例

このプロジェクトは、中国科学院生物物理研究所のある先生が百泰派克でCo-IPサンプルのタンパク質リン酸化修飾部位の同定を行ったものです。得られた一部の結果は下図の通りです。

磷酸化定量蛋白组学分析研究案例

 

リン酸化定量プロテオミクス分析研究事例

 

中/英語プロジェクトレポート

技術報告において、百泰派克は詳細な中英二言語版技術報告を提供します。報告書には以下が含まれます:

1. 実験手順(中英)
2. 関連する質量分析パラメータ(中英)
3. 同定されたリン酸化部位の詳細情報
4. 質量分析画像
5. 生データ

リン酸化定量プロテオミクスワンストップサービス

注文を行い、サンプルを送付するだけ
百泰派克ワンストップサービス完了:サンプル処理-機器分析-データ分析-プロジェクト報告

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