TMTに基づくプロテオミクス分析

タンデム質量タグ（TMT）技術は、Thermo社が開発したタンデム質量分析の標識技術であり、異なるサンプル中のタンパク質を同定および定量するために主に使用されます。各TMT標識試薬は、アミン反応活性を持つNHSエステル基、質量標準化基、およびMS/MSレポーター基から構成されています。各標識試薬の同位体タグは同じ前駆体質量を持ち、試薬標識酵素解離後のペプチドは、アミノ酸のN末端および側鎖の一次アミン基と反応し、レポーター基を介して検出されます。

TMT技術は最大11種類の安定同位体タグを使用でき、最大10種類の異なるサンプル中のタンパク質の相対量を同時に比較できます。ほぼすべてのペプチドまたはタンパク質サンプルを標識できます。TMT標識技術は最大11個のサンプルに適用できるため、TMTは定量的なタンパク質バイオマーカーの発見に広く使用されており、2-plex、6-plex、または10-plexの同位体タグを選択することにより、2グループ、6グループ、または10グループの異なるサンプル中のタンパク質の相対量を同時に比較できます。

TMTに基づくプロテオミクスサービスワークフロー

TMT定量分析は、ペプチド断片化中にタンデム質量分析モード（MS2）で標識された断片レポーターイオンの強度を測定することによって行われます。全スキャンモード（MS1）では、前駆体イオンを選択して断片化を行います。このステップではイオン選択が行われるため、ノイズレベルが低下し、後続の分析ステップに有利な条件が提供されます。理想的には、前駆体イオンの断片化中に、選択された前駆体イオンのみが断片化を起こします。しかし、実際には、他の前駆体イオンも指定されたm/zウィンドウ内でキャプチャされ、選択された前駆体とともに断片化されることがあります。

バイオテックパークバイオテクノロジーは、Thermo FisherのOrbitrap Fusion Lumos質量分析プラットフォームとnanoLC-MS/MSナノリットルクロマトグラフィーを組み合わせ、TMTに基づくプロテオミクス分析サービスを提供しています。Obitrap Fusion Lumos質量分析計は、現在最も高い分解能と感度を誇る質量分析計であり、低濃度ペプチド断片の同定の感度を保証します。また、ペプチド断片化中にHCDとETDを組み合わせたモードを採用し、ペプチド断片の完全性を保証します。

*TMTプロテオミクス分析技術の用途リン酸化プロテオミクス分析。

サンプルについて
バイオテックパークバイオテクノロジーは、液体および固体状態のサンプルに対してTMTプロテオミクス分析を実施することができます。固体サンプルは、氷の袋で輸送するだけで済みます。溶液サンプルは、真空乾燥または冷凍乾燥した後、氷の袋で輸送するか、またはドライアイスでサンプルを輸送することも可能です。ご相談はお気軽にお電話ください。

TMTに基づくプロテオミクス分析

関連サービス