エドマン分解法N末端配列分析
N末端配列はタンパク質の機能と安定性に密接に関連しており、タンパク質のN末端シーケンス分析を行うことでタンパク質の起点を特定し、タンパク質の高次構造を分析し、タンパク質の生物学的機能を明らかにするのに役立ちます。Edman分解法(Edman degradation)は、タンパク質またはペプチドのN末端アミノ酸配列を決定するために、タンパク質N末端のアミノ酸を段階的に除去し、そのタイプを識別します。Edmanシーケンシング反応は循環プロセスであり、弱アルカリ性条件下でペプチド/タンパク質をフェニルイソチオシアネート(PITC)と反応させ、次に酸で処理し、ペプチド鎖からN末端残基のみをアミノ酸のフェニルチオヒダントイン誘導体の形態で遊離させ、分離されたアミノ酸を識別します。各ラウンドの反応で1つのアミノ酸を識別でき、このようにして最終的にN末端アミノ酸配列の識別を実現します。

Edman分解法N末端配列分析図
バイオテックパークBTPは、島津製作所のEdmanシーケンシングシステムに基づいてN末端配列分析プラットフォームを構築し、CNAS/ISO9001の二重品質システム認証を取得し、研究者や研究顧客に精製後のタンパク質製品、抗体、タンパク質ワクチン、組換えコラーゲンなどのN末端シーケンスサービスを提供しています。当社のシーケンシングシステムを使用すると、N末端の30個のアミノ酸の配列情報を決定できます。特定のタンパク質サンプルシステムを使用すると、N末端の60〜70個のアミノ酸を測定できます。無料でご相談いただけますので、詳細情報をご覧ください!
実験装置
- 全自動タンパク質/ペプチドシーケンサー(PPSQ33A)
技術的な利点
- ゲル電気泳動や膜転写の方法でサンプルを処理し、アミノ酸情報を直接分析できます。タンパク質データベースを必要とせずにN末端アミノ酸配列を正確に分析できます。
- イソロイシンとロイシン、グルタミンとリジンを正確に区別できます。
- 全長配列中に混在する切断体(N-1、N-2など)を正確に認識および識別できます。
- 大量の繰り返しフラグメントを含むタンパク質の配列を正確に測定できます。
ケーススタディ
19種類のPTH-アミノ酸を較正するため、まず19種類のPTHアミノ酸の混合標準品をテストし、較正テスト混合標準品のスペクトルは以下のとおりです。

標準品較正テストスペクトル
PTHアミノ酸混合標準品の較正テスト完了後、サンプルのN末端配列をテストし、サンプルテストスペクトルは以下のとおりです。

N末端第1位

N末端第2位

N末端第3位
上記のスペクトルにより、タンパク質のN末端配列がTyr-Val-Trpであることが確認できます。
中/英語プロジェクトレポート
技術報告書では、バイオテックパークは詳細な中英二言語版技術報告書を提供し、報告書には以下が含まれます。
1. 実験手順(中英語)
2. 関連する質量分析パラメータ(中英語)
3. Edman分解法N末端配列分析の詳細情報
4. 質量分析画像
5. 生データ
Edman分解法N末端配列分析その1ワンストップサービス
注文-サンプル送付のみ
バイオテックパークのワンストップサービス:サンプル処理-機器分析-データ分析-プロジェクトレポート
関連サービス
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