疾患のバイオマーカーや薬物ターゲットを探していますか？タンパク質リン酸化分析があなたを助けます！
タンパク質のリン酸化は、可逆的なタンパク質の翻訳後修飾です。哺乳類の細胞のライフサイクル中、少なくとも3分の1のタンパク質がリン酸化修飾を受けます。タンパク質のリン酸化は多くのシグナル伝達経路や細胞代謝過程に関与し、既知の多くの疾患も異常なタンパク質のリン酸化と関連しています。
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多くのリン酸化イベントの機能的結果は既に注釈されており、特にリン酸化が直接その活性を調節するキナーゼに関してです。したがって、タンパク質とプロテオームのリン酸化状態を研究することで、疾患のバイオマーカーを発見し、新しい治療可能性のある薬剤標的を探す手助けとなります。
1.論文タイトル：Fyn Tyrosine Kinase Elicits Amyloid Precursor Protein Tyr682 Phosphorylation in Neurons from Alzheimer’s Disease Patients
雑誌：Cells
インパクトファクター：4.366
発表日：2020年7月30日
論文リンク：https://www.mdpi.com/2073-4409/9/8/1807/htm
アルツハイマー病（AD）は、現時点で治療不可能な神経変性疾患ですが、いくつかの早期検出戦略があります。研究者は以前、アミロイド前駆体タンパク質（APP）チロシン682（Tyr682）残基がADの新薬開発または診断介入の重要な標的となり得ることを提案しました。APPがTyr682でリン酸化されると、酸性ニューロン区画に強制的に入り、神経毒性のアミロイドβペプチド（Aβペプチド）を生成するために加工されます。興味深いことに、ADニューロンにおいてFynチロシンキナーゼ（TK）とAPP Tyr682残基の相互作用が増加しています。本論文では、研究者がFyn TKが過剰発現すると、健康なドナーからのニューロンにおけるAPP Tyr682リン酸化を引き起こし、Aβペプチドの蓄積とニューロンの死を通じてアミロイドタンパク質APPの加工を促進することを証明しました。AD患者のニューロンでは、APPのTyrでのリン酸化（pAPP-Tyr）が増加し、高pAPP-Tyrを示すADニューロンはFyn TK活性も高いです。Fyn TKの抑制はADニューロンにおけるpAPP-Tyrを排除し、Aβ42の分泌を減少させました。さらに、多ドメインアダプタータンパク質Fe65はFynによるpAPP-Tyrを制御し、Fe65-APP-Fyn経路を標的にしたADの新しい戦略の開発可能性を示しています。総じて、これらの結果はFyn TKIを使用して診断目的（ADの早期バイオマーカーとして）または薬理標的としてpAPP Tyr682の重要性を強調しています。
AD患者のニューロンにおいてアミロイド前駆体タンパク質がTyr残基でリン酸化されている
2.論文タイトル：The Global Phosphorylation Landscape of SARS-CoV-2 Infection
雑誌：Cell
インパクトファクター：38.637
発表日：2020年8月6日
論文リンク：https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0092867420308114
2019年に始まったコロナウイルス病（COVID-19）のパンデミックでは、重症急性呼吸器症候群コロナウイルス2（SARS-CoV-2）の病原体が数百万人に感染し、数十万人の死者をもたらしました。抗ウイルス療法の開発が緊急に求められています。本研究では、定量的質量分析に基づくSARS-CoV-2感染のVero E6細胞におけるリン酸化プロテオミクス調査を紹介し、宿主およびウイルスタンパク質のリン酸化の顕著な再編成を明らかにしました。SARS-CoV-2感染はカゼインキナーゼII（CK2）およびp38 MAPKの活性化、さまざまなサイトカインの生成、および有糸分裂キナーゼのシャットダウンを促進し、細胞周期の停止を引き起こしました。感染はまた、CK2を含むウイルス粒子の出芽を伴うフィラメント状突起の生成を顕著に誘導しました。SARS-CoV-2感染により変化したキナーゼと経路に全体的リン酸化プロファイルをマッピングすることで、87種のFDA承認済みの臨床試験または臨床前開発中の薬剤と化合物がSARS-CoV-2を標的とする薬剤としてスクリーニングされました。研究者は、p38、CK2、CDK、AXL、およびPIKFYVEキナーゼの薬理学的抑制が抗ウイルス効果を持ち、潜在的なCOVID-19療法を代表する可能性があることを発見しました。
SARS-CoV-2感染後のリン酸化と豊度の変化の全体的なプロテオミクス
百泰派克バイオテクノロジーは、Thermo FisherのQ Exactive HF質量分析プラットフォーム、Orbitrap Fusion質量分析プラットフォーム、Orbitrap Fusion Lumos質量分析プラットフォームをNano-LCと組み合わせて使用し、タンパク質リン酸化部位の同定とリン酸化定量プロテオーム解析サービスを提供する技術パッケージを展開しています。実験目的を教えていただき、サンプルを送っていただければ、百泰派克がプロジェクトの後続作業を担当します。これにはタンパク質抽出、タンパク質の酵素切断、リン酸化ペプチドの濃縮、ペプチドの分離、質量分析、質量分析の生データ解析、生物情報学解析が含まれます。
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