未知タンパク質の配列決定

タンパク質のアミノ酸配列は、タンパク質の構造と機能を決定する基盤であり、タンパク質シーケンスは、タンパク質を構成するアミノ酸の種類と配列を測定することで、プロテオミクス研究の重要な内容です。一般的な方法には質量分析法（例：タンデム質量分析）とEdman分解法があります。未知のタンパク質（unknown protein）とは、まだ十分に研究されておらず、記述されていないタンパク質を指します。これらのタンパク質は、新しく発見された遺伝子によってコードされている可能性があるか、または既知の生物体の遺伝子産物であるものの、構造、機能、および役割が完全に理解されていないものです。未知タンパク質のシーケンスは、生物のゲノムとプロテオームの全貌を明らかにするのに役立ちます。，タンパク質の構造と機能の研究にとって、バイオテクノロジー、医薬品開発、疾病診断などの分野の進展を促進する上で重要な意味を持ちます。

バイオテック社BTPは、Thermo社が新しく発売したObitrap Exploris 240質量分析計を基に、未知タンパク質サンプルのシーケンス分析を実現します。6種類の一般的なプロテアーゼ（トリプシン、キモトリプシン、Asp-N、Glu-C、Lys-C、Lys-N）を用いてターゲットタンパク質を酵素消化し、質量分析を行い、ペプチド断片の同時取得とペプチド間の接続によって、タンパク質シーケンスを100%決定します。

バイオテックバイオテックBTP未知タンパク質のシーケンスプロセス

1. サンプル準備：

タンパク質を抽出し、精製過程を通じて不純物を除去します。

2. タンパク質の分類/分離：

タンパク質サンプルを分類または分離し、通常は1次元または2次元ゲル電気泳動（1D/2D-PAGE）および液体クロマトグラフィー（例：HPLC）などの方法を用います。

3. タンパク質消化/分解：

多重酵素消化（例：トリプシン、キモトリプシン、Asp-N、Glu-C、Lys-C、Lys-N）を用いて、タンパク質をより小さなペプチドに分解し、その後の質量分析を容易にします。。

4. ペプチド分離：

液体クロマトグラフィー（例：逆相高性能液体クロマトグラフィー、RP-HPLC）を用いてプロテアーゼ消化で得られたペプチドをさらに分離します。

5. 質量分析：

ペプチドを質量分析計で分析し、質量分析の結果によりペプチドの質量、電荷状態などの情報を得ることができます。

6. ペプチドシーケンス：

タンデム質量分析（例：MS/MS）を用いてペプチドをさらにシーケンスします。

7. データ処理と分析：

専用の質量分析ソフトウェア（例：Mascot、Sequest）を用いて、既知のタンパク質データベースと組み合わせて質量分析データを分析処理します。

未知タンパク質シーケンス技術の主な応用

1. 新タンパク質の発見：

未知のタンパク質のシーケンスと機能注釈を通じて、新しい生物触媒、シグナル伝達タンパク質、転写因子などの分子機能を発見できます。

2. タンパク質機能研究：

タンパク質のシーケンスを通じて、機能注釈とタンパク質相互作用ネットワーク研究にデータサポートを提供します。

3.疾病マーカーの発見：

病理組織と正常組織のプロテオームを比較することにより、潜在的な疾病マーカーを発見し、疾病診断と治療の手がかりを提供します。

4. 医薬品開発：

薬物作用の標的タンパク質を特定するために使用され、新しい薬物標的を発見することで，新薬の開発と最適化を加速するのに役立ちます。

サンプルについて

以下の種類のサンプルを受け付けています：

1.精製タンパク質：純度85%以上のタンパク質サンプルを提供してください。推奨送付量は50-200µgであり、タンパク質濃度は0.1-1mg/mLの範囲内であるべきです。。

2.プロテオーム抽出物：細胞、組織、または生物体からのプロテオーム抽出物を含むがこれに限定されません。推奨送付量は200-500µgであり、タンパク質濃度は1-5mg/mLの範囲内であるべきです。

3. タンパク質ゲルスポット/ゲルストリップ：1D-SDS PAGEで分離されたタンパク質ゲルストリップ、2DE PAGEのタンパク質ゲルスポット、IP、Co-IPサンプルおよびGST融合タンパク質プルダウンなどの精製サンプル中のタンパク質/タンパク質混合物。ゲルスポットおよびゲルストリップの場合、タンパク質含有量が少なくとも10ngであることを保証し、免疫沈降サンプルの場合、少なくとも20µgのタンパク質を提供してください。

中/英プロジェクトレポート

技術レポートでは、バイオテック社が詳細な中英二言語版技術レポートを提供します。レポートには以下が含まれます：

1. 実験手順（中英）

2. 関連する質量分析パラメータ（中英）

3. 未知タンパク質シーケンスの詳細情報

4. 質量分析画像

5. 生データ

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