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質量分析法N末端配列分析

質量分析法によるN末端シークエンシングは、質量分析技術を利用して、タンパク質/ペプチドのN末端アミノ酸配列を高効率かつ正確に決定する方法です。その高感度、高分解能、高スループットの利点から、複雑なタンパク質/ペプチド混合物の解析や、修飾、変異、その他の配列変異の同定に使用されます。従来のEdman分解法と比較して、質量分析法はより高いスループットと感度を持ち、より複雑なサンプルやより大きなタンパク質を解析することができます。

 

高分解能質量分析法に基づくN末端シークエンシングでは、SDS-PAGEで目的のタンパク質を分離した後、プロテアーゼで消化し、消化後の生成物をQ-Exactiveシリーズ質量分析計(Thermo Fisher Scientific)で分析します。ペプチドが質量分析計でフラグメント化され、bおよびyイオンの二次質量分析図を生成し、理論的なタンパク質アミノ酸配列と照合してタンパク質のN末端位置を特定します。バイオテクノロジー企業のBTPは、高効率液体クロマトグラフィーと高分解能質量分析計を組み合わせ、N末端シークエンシング原理に基づく質量分析法のN末端シークエンス解析プラットフォームを構築しました。BTPはCNAS/ISO9001の二重品質システム認証を取得しており、高品質な質量分析法によるN末端シークエンス解析サービスを提供します。2つの異なるプロテアーゼを使用して2つの異なる長さのN末端ペプチドを生成し、相互に検証して最終的にタンパク質のN末端配列を特定します。無料でご相談いただけます!詳細についてはお問い合わせください。

 

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質量分析法によるN末端シークエンス解析の2つの酵素切断法の比較

 

実験装置

 

  • 高効率液体クロマトグラフィー-質量分析計:高効率液体クロマトグラフィー装置-Easy-nLC 1200
  • エレクトロスプレー-組み合わせ型イオントラップOrbitrap質量分析計-Q Exactive™ Hybrid

 

Quadrupole-Orbitrap™ Mass Spectrometer

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技術的な利点

 

  • 高分解能質量分析法に基づくN末端シークエンシングにより、高分解能質量分析を通じてN末端の閉塞と翻訳後修飾(PTMs)を解析し、タンパク質のN末端開始点を特定することができます。
  • 複雑なタンパク質に対して、当社は複雑なタンパク質にN末端ジメチル化標識を行い、標識位置を分析して複数のタンパク質のN末端開始点を特定することをサポートします。

 

ケーススタディ

 

タンパク質医薬品サンプルのN末端アミノ酸配列解析:

トリプシンで消化したサンプルをLC-MS/MSで分析し、得られた質量分析データを理論データベースと照合し、理論N末端配列(HYAHVDCPGHADYVK)と一致するMS2スペクトラムを得ました。スペクトラムは以下の通りです:

 

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N末端シークエンスの二次質量分析図

 

以上の分析から、このタンパク質医薬品のN末端開始アミノ酸はヒスチジンであり、N末端シークエンスはHYAHVDCPGHADYVKであることがわかります。

 

中/英語プロジェクトレポート

 

技術レポートでは、BTPは詳細な中英二言語技術レポートを提供し、レポートには以下が含まれます:

1. 実験手順(中英)
2. 関連する質量分析のパラメータ(中英)
3. 質量分析法によるN末端シークエンス解析の詳細情報
4. 質量分析画像
5. 元データ

 

質量分析法によるN末端シークエンス解析一ワンストップサービス

 

ご注文-サンプル送付だけで完了
BTPのワンストップサービスで:サンプル処理-機器分析-データ解析-プロジェクトレポートを完了

 

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