ペプチドバイオマーカーの同定
バイオマーカーは、正常な生物学的プロセス、病理プロセス、または治療介入の薬理学的反応の指標として測定および評価できる特徴です。ペプチドは理想的なバイオマーカーとして利用できます。ペプチドは生体内のさまざまな部位間を移動できるため、多くの病原プロセスは異なる体液中のペプチドの組成の特徴、病理学的変化によって反映されます。さまざまな疾患に関連するペプチドの豊富さの変化が検出可能です。
ペプチドバイオマーカーの開発には、2つの一般的なアプローチがあります: パターン認識と単一/少数バイオマーカー検出です。パターン認識法では、候補バイオマーカーの識別情報を取得する必要はなく、MSの高特異性と感度に頼ることで患者情報を得ることができます。パターン認識に比べて、単一/少数バイオマーカーはより有用で信頼性が高く、収集されたさまざまな由来の生体サンプルからペプチドの発現レベルの差異を検証できます。質量分析を基にした分析方法は、分析物分子の濃度を示すことができ、非常に高い特異性を持ちます。これは、質量分析が正確な大分子の質量とシーケンス能力に基づいているためです。
Lee, J. E. Genomics & Informatics. 2016.
ペプチドバイオマーカーの識別
ペプチドバイオマーカーのスクリーニングと検証には、ペプチドがサンプル中に存在することを確認する（定性）と、対応する濃度を決定する（定量）という2つのステップが必要です。これらの組み合わせによって候補ペプチドを選別できます。バイオマーカーの検出には多くの分析技術が使用されています。特に、質量分析技術と液相クロマトグラフィー（UPLCやnanoLCなど）を組み合わせることが、高分解能、高感度、高スループット、定量機能を備えた最適な分析プラットフォームとされます。
百泰派克生物科技は、Thermo FisherのOrbitrap Fusion Lumos質量分析プラットフォームとnanoLC-MS/MSナノスケールクロマトグラフィーを組み合わせて、ペプチドバイオマーカー識別サービスを提供しています。
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