ペプチドデノボシーケンシング

ペプチドのシーケンス分析には一般的に二つの方法があります：データベース検索とデノボ（de novo）シーケンシング法です。データベース検索は既知/提供されたデータベース内で検索を行い、ペプチドシーケンスを識別します。しかし、いくつかの種のデータベースが不十分であるため、多くの新しいまたは活性のあるペプチドがデータに一致しないことがあります。ペプチドのデノボシーケンシングはこの問題を解決できます。ペプチドのデノボシーケンシングとは、シーケンスデータベースの助けを借りずに、タンデム質量分析（MS/MS）を用いてペプチドのアミノ酸シーケンスを取得する分析プロセスを指します。これは理論的なデータベースがあるかどうかに関係なく、新しい、未知のペプチドでもシーケンス分析が可能なという利点があります。

デノボシーケンシングの基本原理は、2つのフラグメントイオン間の質量差を利用して、ペプチド鎖上のアミノ酸残基の質量を計算することです。ペプチドのデノボシーケンシング技術の実現は質量分析技術の発展と密接に関連しています。近年、質量分析計の質量分解能は数桁向上しており、特に高精度な質量分析性能の著しい向上はペプチドシーケンス分析に強力な基盤を提供しています。

ペプチドデノボシーケンシング 高品質スペクトル理論フラグメントイオン図

百泰パイクリバイオテクノロジーは、Thermo社の最新のObitrap Fusion Lumos質量分析計とNano-LCナノリットルクロマトグラフィー技術を組み合わせ、質量分析に基づくペプチドのデノボシーケンシングサービスを提供し、ペプチドシーケンスを分析します。百泰パイクはThermo社の最新のObitrap Fusion Lumos質量分析計を使用してペプチドサンプルのシーケンス分析を実現し、Obitrap Fusion Lumos質量分析計は現在の分解能と感度が最も高い質量分析計で、低濃度のペプチドフラグメントの識別感度を保証します。同時に、ペプチドフラグメントの過程でHCDとETDを組み合わせたモードを採用し、ペプチドフラグメントの完全性を保証します。質量分析の元データを得た後、デノボシーケンシングの方法を用いてペプチドシーケンスを推定します。

サンプル準備の推奨事項：
できるだけ20μg以上のサンプルを準備し、溶液と凍結乾燥粉末の両方が可能です。溶液サンプルの場合、バッファー中に高塩、SDSなどの界面活性剤が含まれていないことを確認してください。

**百泰パイクリバイオテクノロジーの技術者に相談し、サンプル準備を特別に調整することができます。

百泰パイクリバイオテクノロジーは、液体および固体状態のサンプルからペプチドシーケンス分析を行うことができます。固体サンプルはアイスパックで輸送可能です。溶液サンプルは真空乾燥または冷凍乾燥後にアイスパックで輸送することもできます。また、ドライアイスを使用してサンプルを輸送することも可能です。お気軽にお問い合わせください。