タンパク質のSUMO化同定

小ウビキチン様修飾（small ubiquitin-like modifier, SUMO）は、タンパク質の翻訳後修飾の一種で、タンパク質に小さなウビキチン様修飾因子（SUMO）を共有結合することを指します。ウビキチン化とは異なり、SUMO化はタンパク質分解を標的とせず、細胞核-細胞質輸送、転写調節、アポトーシス、タンパク質の安定性、ストレス応答、細胞周期の進行など、さまざまな細胞プロセスでタンパク質機能を調節します。SUMOとウビキチンはアミノ酸配列の類似性が低いものの、ほぼ同じ立体構造を持っています。SUMOの長さは約100アミノ酸です。SUMOの配列の長さと質量は、SUMOファミリーのメンバー間や異なる生物体で異なります。

SUMO化は、多くの標的タンパク質の細胞内局在の調節に関与しています。標的タンパク質によって、SUMO化は細胞質または核内で起こることがあります。例えば、SUMOの追加によって、核糖核タンパク質RanGAP1のNPC内輸送を調節できます。SUMO化は転写プロセスも調節します。多くの転写因子の活性はPMLおよびNBとの相互作用に関連しており、PMLおよびNBの組み立てにはPMLタンパク質のSUMO化が必要です。さらに、SUMO化は染色体の凝集や動原体の組み立てに重要な役割を果たします。SUMO-1の機能不全は、複製細胞における染色体の正しい分布を破壊します。

タンパク質SUMO化の識別

百泰派克バイオテクノロジーは、Thermo FisherのOrbitrap Fusion Lumos質量分析プラットフォームとnanoLC-MS/MSナノスケールクロマトグラフィーを組み合わせ、タンパク質SUMO化分析サービスパッケージを提供しています。実験の目的を教えていただき、サンプルを送っていただければ、プロジェクトの後続のすべての事務を担当します。

SUMO化識別サービスの一般的な流れ

1. ゲルまたは溶液中でタンパク質を消化します。
2. 特定のSUMO化モチーフを標的とする抗体でSUMO化タンパク質を濃縮します。
3. HPLCで分離し、ESI-TOF MS/MS分析を行います。
4. 質量分析データを解析します。

百泰派克が提供する以下のバイオインフォマティクスサービス

機能注釈と富化分析
クラスタリング分析
ネットワーク分析
統計分析
翻訳後修飾プロテオミクス分析

関連サービス

ウビキチン化定量プロテオミクス研究
翻訳後修飾プロテオーム分析
ヒストン翻訳後修飾分析
タンパク質識別
タンパク質ジスルフィド結合識別および定量分析
S-ニトロシル化分析