ユビキチン化定量プロテオミクス研究

BTP-ユビキチン化定量プロテオミクス研究

ユビキチン化修飾は重要な翻訳後修飾の一つです。ユビキチン-プロテアソームシステムは真核生物内の80%~85%のタンパク質分解を媒介します。さらに、ユビキチン化修飾はタンパク質の活性や定位に直接影響を与え、細胞周期、細胞死、転写調節、DNA損傷修復、免疫応答などの多様な細胞活動を調節します。

バイターパック社はThermo FisherのQ ExactiveHF質量分析プラットフォーム、Orbitrap Fusion質量分析プラットフォーム、Orbitrap Fusion Lumos質量分析プラットフォームをNano-LCと組み合わせ、ユビキチン化定量プロテオーム分析サービスを提供しています。実験の目的を教えていただき、サンプルをお送りいただければ、タンパク質抽出、タンパク質消化、ユビキチン化ペプチドの濃縮、ペプチド分離、質量分析、質量分析の生データ分析、生物情報学分析など、プロジェクトの全てを担当いたします。

翻訳後修飾されたタンパク質は生物サンプル中の含量が低く、動的範囲が広いため、質量分析前に修飾を濃縮してその豊度を高め、従来の定量プロテオーム分析手法を用いて濃縮されたユビキチン化ペプチドサンプルを定量分析します。バイターパック社はNature Protocolに掲載された記事「Large-scale identification of ubiquitination sites by mass spectrometry」に基づいてこの分析サービスの実験プラットフォームを構築し、完全に複製する方式を採用しています。まずユビキチン化されたタンパク質をトリプシン消化し、リジンの修飾部位で二つのグリシン残基（K-GG）が生成されます。CST社提供のこの残基に特異的な試薬キットを用いてユビキチン化ペプチドを特異的に濃縮します。HPLCを用いてサンプルを事前分離し、特殊な残基構造の抗体を用いてユビキチン化ペプチドを濃縮し、ユビキチン化タンパク質の同定量を大幅に向上させます。また、Nature Protocolの記事に基づき、より多くのアセチル化ペプチドを同定・定量するために、消化過程で2~3種類の異なる酵素を使用してタンパク質サンプルを消化し、アセチル化部位を持つペプチドが高イオン化効率で質量分析に進入し、ペプチド長が適さずイオン化効率が低いためにアセチル化情報が失われることを排除します。

ユビキチン化修飾研究ルート

BTP-ユビキチン化定量プロテオミクス研究分析サンプル要求

1. 組織サンプルをご提供の場合、ドライアイスで組織サンプルをお送りください。植物組織サンプルは400mg以上、血液サンプルは少なくとも2ml（血漿はEDTAを使用して凝固防止）、血清は2ml、尿は10ml、動物組織サンプルは少なくとも2g、細胞サンプルは1X10^8個の細胞、酵母、微生物などは乾燥重量で400mgです。
2. タンパク質サンプルをご提供の場合、タンパク質総量が2-5mgであることを保証してください。タンパク質抽出時には通常の組織、細胞溶解液を使用してください。
3. サンプル輸送：十分な量のドライアイスを使用して輸送し、できるだけ早い郵送方法を選択して、輸送中のサンプルの分解の可能性を低減してください。
4. 正式な実験の前に、提供されたサンプルを検査し、検査が合格した後に正式な実験を開始します。

BTP-ユビキチン化定量プロテオミクス研究ケース

ユビキチン化修飾研究ケース

中/英語プロジェクト報告書

技術報告書では、バイターパックは詳細な中英バイリンガル技術報告書を提供します。報告書には以下が含まれます：

1. 実験手順（中英）
2. 関連する質量分析パラメータ（中英）
3. 同定されたユビキチン化部位の詳細情報
4. 質量分析画像
5. 生データ

BTP-ユビキチン化定量プロテオミクスワンストップサービス

注文-サンプル送付のみバイターパックワンストップサービス完了：サンプル処理-機器分析-データ分析-プロジェクト報告書